50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1497 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1497  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  892    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1720  hypothetical protein  64.8 
 
 		 432 aa  600  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26756  normal  0.377885 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0907  hypothetical protein  47.8 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.68427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1941  hypothetical protein  43.57 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3838  hypothetical protein  42.62 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1112  hypothetical protein  40.97 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08450  hypothetical protein  39.86 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1253  hypothetical protein  38.73 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.325224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1362  hypothetical protein  37.83 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2914  hypothetical protein  38.57 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  24.35 
 
 		 426 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1610  hypothetical protein  25 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640568  unclonable  5.93437e-23 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  27.73 
 
 		 468 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1771  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  22.15 
 
 		 740 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.69 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0089  hypothetical protein  26.03 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.678836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  23.48 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1430  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.08 
 
 		 1073 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1370  carbamoyl-phosphate synthase large chain  24.08 
 
 		 1073 aa  50.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  26.07 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0708  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  26.05 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.22 
 
 		 1059 aa  47  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4717  pyruvate carboxylase  24.29 
 
 		 1169 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  22.97 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1321  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.71 
 
 		 1109 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.149141 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  25.43 
 
 		 1822 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.99 
 
 		 1099 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2914  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.25 
 
 		 1070 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3085  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  34.15 
 
 		 1076 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2272  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  29.31 
 
 		 1030 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.81 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1541  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  33.73 
 
 		 1077 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2760  putative biotin carboxylase subunit of acetyl-CoA carboxylase  26.34 
 
 		 681 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868183  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  23.55 
 
 		 1207 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  25 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2521  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  25.07 
 
 		 1832 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0775  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.09 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.486774  normal  0.246438 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  25.77 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1999  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.54 
 
 		 1109 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000570089 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.67 
 
 		 1099 aa  43.5  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.67 
 
 		 1099 aa  43.5  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1957  pyruvate carboxylase  23.45 
 
 		 1148 aa  43.5  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1457  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.75 
 
 		 1109 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1856  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.38 
 
 		 1115 aa  43.5  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.977925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1088  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.08 
 
 		 1157 aa  43.5  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1217  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.08 
 
 		 1157 aa  43.5  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1298  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  28.99 
 
 		 1093 aa  43.1  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0243124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1868  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.21 
 
 		 1067 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1812  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.43 
 
 		 1080 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00557421  normal  0.0258544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1516  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.75 
 
 		 1109 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>