57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0907 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0907  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  890    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.68427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1112  hypothetical protein  51.98 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3838  hypothetical protein  47.53 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1941  hypothetical protein  47.53 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1720  hypothetical protein  47.65 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26756  normal  0.377885 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1497  hypothetical protein  47.8 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1362  hypothetical protein  44.86 
 
 		 438 aa  353  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2914  hypothetical protein  45.97 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08450  hypothetical protein  43.6 
 
 		 422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1253  hypothetical protein  41.63 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.325224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  32.91 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  26.03 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1610  hypothetical protein  24.73 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640568  unclonable  5.93437e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1771  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  23.12 
 
 		 740 aa  97.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.49 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1375  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  24.06 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0154864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2955  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  27.47 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261776 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0779  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  30.77 
 
 		 475 aa  53.1  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1064  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  22.32 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000351305  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.95 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  28.87 
 
 		 1212 aa  49.7  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1587  pyruvate carboxylase subunit A  24.37 
 
 		 493 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  26.19 
 
 		 1200 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  28.44 
 
 		 1208 aa  47.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  29.96 
 
 		 1201 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10656  conserved hypothetical protein  32.89 
 
 		 795 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.426942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  34.55 
 
 		 1201 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1728  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  28.93 
 
 		 626 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00036271  normal  0.117337 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  24.5 
 
 		 1822 aa  47  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  23.81 
 
 		 350 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  23.01 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0548  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  29.26 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6239  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.85 
 
 		 958 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1087  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  33.04 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  35.42 
 
 		 498 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0466  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  27.01 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0174688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0548  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  28.04 
 
 		 1517 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0031  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  34.69 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.83 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2962  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  27.1 
 
 		 1517 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1477  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.15 
 
 		 1054 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  30.22 
 
 		 1204 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  27.62 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0840  acetyl-CoA carboxylase multifunctional enzyme accADC, carboxyl transferase subunit alpha/carboxyl transferase subunit beta/biotin carboxylase  22.22 
 
 		 1517 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  25.76 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  22.52 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0119  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  26.27 
 
 		 492 aa  43.9  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.334605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3218  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  27.1 
 
 		 1516 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.1606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44400  predicted protein  29.2 
 
 		 2012 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3703  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  24.52 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184442  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  27.98 
 
 		 1212 aa  43.9  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0605  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  26.67 
 
 		 1517 aa  43.5  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2198  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  30.43 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000374542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4206  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  36.23 
 
 		 1077 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3155  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  22.22 
 
 		 1517 aa  43.1  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.634219  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  26.6 
 
 		 1207 aa  43.1  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1554  biotin carboxylase  23.45 
 
 		 444 aa  43.1  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>