39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1112 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1112  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  894    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0907  hypothetical protein  51.98 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.68427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3838  hypothetical protein  47.54 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1941  hypothetical protein  45.43 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1720  hypothetical protein  41.57 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26756  normal  0.377885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1362  hypothetical protein  40.65 
 
 		 438 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08450  hypothetical protein  41.65 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1497  hypothetical protein  40.97 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2914  hypothetical protein  42.02 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1253  hypothetical protein  40.93 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.325224 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  26.23 
 
 		 426 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1610  hypothetical protein  26.46 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640568  unclonable  5.93437e-23 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  28.23 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1771  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.09 
 
 		 740 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.32 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  26.04 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  23.73 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.56 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.92 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  23.38 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6239  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.81 
 
 		 958 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1710  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.67 
 
 		 1136 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0089  hypothetical protein  22.48 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.678836  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  26.44 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  23.94 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12580  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.27 
 
 		 1101 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0991038  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.41 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  23.15 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.15 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1999  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28 
 
 		 1109 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000570089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1298  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  27.36 
 
 		 1093 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0243124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3198  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.67 
 
 		 1130 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00397433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.79 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1849  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  30.67 
 
 		 1115 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.95 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  26.27 
 
 		 1200 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2476  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.81 
 
 		 947 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2431  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.67 
 
 		 1143 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2456  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.46 
 
 		 1096 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>