25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1720 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1720  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  897    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26756  normal  0.377885 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1497  hypothetical protein  64.8 
 
 
433 aa  600  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0907  hypothetical protein  47.65 
 
 
433 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.68427  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1941  hypothetical protein  46.14 
 
 
428 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3838  hypothetical protein  44.44 
 
 
428 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1112  hypothetical protein  41.57 
 
 
433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1253  hypothetical protein  37.3 
 
 
444 aa  293  5e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.325224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08450  hypothetical protein  37.59 
 
 
422 aa  289  9e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1362  hypothetical protein  35.45 
 
 
438 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2914  hypothetical protein  36.36 
 
 
432 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  26.85 
 
 
426 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1610  hypothetical protein  25.87 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640568  unclonable  5.93437e-23 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  25.71 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1771  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  23.69 
 
 
740 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212253  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.46 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  24.63 
 
 
437 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.04 
 
 
411 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0089  hypothetical protein  24.46 
 
 
431 aa  46.6  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.678836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  25.35 
 
 
424 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.76 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  28.41 
 
 
1822 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  22.97 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2678  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  28.29 
 
 
1067 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  24.88 
 
 
424 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2550  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  28.29 
 
 
1067 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>