203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1771 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1771  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  100 
 
 
740 aa  1523    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212253  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.63 
 
 
293 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0907  hypothetical protein  23.12 
 
 
433 aa  97.4  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.68427  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.57 
 
 
285 aa  92.4  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.39 
 
 
302 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08450  hypothetical protein  26.2 
 
 
422 aa  88.6  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.36 
 
 
302 aa  88.2  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  27.08 
 
 
294 aa  87.4  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1362  hypothetical protein  27.71 
 
 
438 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  24.79 
 
 
300 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1112  hypothetical protein  25.09 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  26.42 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3838  hypothetical protein  27.33 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  27.02 
 
 
300 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  25.9 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000386621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1941  hypothetical protein  25.47 
 
 
428 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.89 
 
 
301 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.89 
 
 
301 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  25.32 
 
 
546 aa  80.5  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2914  hypothetical protein  24 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.15 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1433  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.15 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  26.21 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.27 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  26.21 
 
 
300 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  27 
 
 
289 aa  77  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  27.38 
 
 
308 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  24.5 
 
 
300 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.51 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.52 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.01 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.15283  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.53 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.61 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.33 
 
 
569 aa  74.3  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1253  hypothetical protein  26.41 
 
 
444 aa  73.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.325224 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  23.87 
 
 
288 aa  73.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  23.87 
 
 
288 aa  72.8  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1720  hypothetical protein  23.69 
 
 
432 aa  71.6  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26756  normal  0.377885 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5175  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.66 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0979633  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3700  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  26.34 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.26 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.32 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4143  gluconolactonase  24.31 
 
 
291 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670498  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  24.89 
 
 
296 aa  70.5  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1497  hypothetical protein  22.15 
 
 
433 aa  70.5  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  23.94 
 
 
426 aa  70.1  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3588  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.37 
 
 
292 aa  69.7  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1610  hypothetical protein  24.41 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640568  unclonable  5.93437e-23 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.85 
 
 
304 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000466286  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2130  Smp-30/Cgr1 family protein, putative  24.9 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.111532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  24.51 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2046  putative Smp-30/Cgr1 family protein  24.9 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00767899  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5696  calcium-binding protein  27.05 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.086452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0358  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.9 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.0997512 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5895  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.3 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0487304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.83 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.52 
 
 
312 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0784  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.6 
 
 
302 aa  66.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1273  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.69 
 
 
297 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.753643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4224  gluconolactonase  26.82 
 
 
308 aa  65.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4591  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.85 
 
 
300 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2314  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  21.03 
 
 
295 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122885  normal  0.0745328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0048  L-arabinonolactonase  25.85 
 
 
300 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0183  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.39 
 
 
316 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0284148  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.51 
 
 
309 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2370  senescence marker protein-30 (SMP-30)  23.55 
 
 
290 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0840  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.86 
 
 
311 aa  63.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  26.17 
 
 
309 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5221  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.85 
 
 
300 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5638  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.85 
 
 
300 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  22.13 
 
 
295 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4633  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.74 
 
 
335 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0500  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.39 
 
 
295 aa  62.4  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2637  senescence marker protein-30 family protein  23.55 
 
 
290 aa  62  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0164591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2755  hypothetical protein  26.36 
 
 
303 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.38 
 
 
310 aa  61.2  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal  0.596869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0517  gluconolactonase  23.18 
 
 
311 aa  61.2  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5444  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.84 
 
 
295 aa  60.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0165  gluconolactonase  27.74 
 
 
316 aa  60.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01688  calcium homeostasis protein Regucalcin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08610)  23.96 
 
 
442 aa  60.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.861839  normal  0.297769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  26.87 
 
 
299 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  24.37 
 
 
284 aa  60.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51450  gluconolactonase  26.82 
 
 
284 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00122  regucalcin  23.21 
 
 
303 aa  60.1  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.97 
 
 
318 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0543  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.93 
 
 
295 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1452  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.42 
 
 
291 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684281  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.31 
 
 
289 aa  58.5  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.72815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  26.75 
 
 
307 aa  58.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  22.11 
 
 
289 aa  57.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02380  conserved hypothetical protein  25.74 
 
 
317 aa  57.4  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25 
 
 
290 aa  57  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0550  L-arabinonolactonase  29.61 
 
 
304 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621286  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41751  predicted protein  26.01 
 
 
328 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000044531  hitchhiker  0.0048622 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.75 
 
 
291 aa  56.2  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.11 
 
 
296 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0622  senescence marker protein-30 family protein  26.97 
 
 
311 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0845  senescence marker protein-30 family protein  26.97 
 
 
311 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1810  senescence marker protein-30 family protein  26.97 
 
 
311 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>