283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3700 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3700  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  100 
 
 
289 aa  584  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0016  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.04 
 
 
294 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.726882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0015  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.13 
 
 
294 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.2 
 
 
301 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.2 
 
 
301 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0014  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  36.74 
 
 
294 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.96 
 
 
287 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.1 
 
 
569 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  36.26 
 
 
289 aa  165  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  39.54 
 
 
302 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.64 
 
 
293 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2259  gluconolactonase  34.52 
 
 
315 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0162749  unclonable  0.0000000178231 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  31.01 
 
 
288 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  33.33 
 
 
300 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  34.07 
 
 
296 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  33.33 
 
 
303 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  31.01 
 
 
288 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.64 
 
 
292 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.28 
 
 
312 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  33.33 
 
 
300 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  32.86 
 
 
290 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  32.98 
 
 
300 aa  148  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.25 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.84 
 
 
285 aa  146  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  31.91 
 
 
300 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  31.91 
 
 
300 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000386621 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.6 
 
 
304 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.79 
 
 
309 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.14 
 
 
292 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.35 
 
 
281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2755  hypothetical protein  32.96 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.94 
 
 
289 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.89 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  31.73 
 
 
546 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2314  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.27 
 
 
295 aa  132  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122885  normal  0.0745328 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.03 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.48 
 
 
293 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  31.32 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3407  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.71 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13947  normal  0.0742686 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2337  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.62 
 
 
289 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992536  normal  0.0209348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0550  L-arabinonolactonase  32.64 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621286  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0125  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.21 
 
 
286 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.1 
 
 
302 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  29.23 
 
 
300 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.1 
 
 
302 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.94 
 
 
289 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.63 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.94 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1592  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.12 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.93 
 
 
299 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.94 
 
 
293 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4591  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.5 
 
 
300 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.96 
 
 
574 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0048  L-arabinonolactonase  31.14 
 
 
300 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  30.9 
 
 
293 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41751  predicted protein  32.06 
 
 
328 aa  115  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000044531  hitchhiker  0.0048622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  29.82 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0419  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.04 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.52 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1292  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.1 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4143  gluconolactonase  31.4 
 
 
291 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670498  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.14 
 
 
293 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.72 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5221  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  31.84 
 
 
300 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5638  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.84 
 
 
300 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.35 
 
 
295 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0604  gluconolactonase  31.51 
 
 
288 aa  112  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0638316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.84 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000466286  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2591  gluconolactonase  30.38 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000189317  normal  0.0284024 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.91 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.15283  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2571  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.41 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233694  normal  0.0110739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.12 
 
 
294 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  27.62 
 
 
303 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4759  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.51 
 
 
288 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0122  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.56 
 
 
308 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271646  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  29.33 
 
 
295 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0568  regucalcin family protein  29.89 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  29.05 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2370  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.23 
 
 
290 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  27.94 
 
 
291 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1529  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.06 
 
 
292 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1625  senescence marker protein-30 family protein  30.43 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2084  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.5 
 
 
300 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206563  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5473  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.96 
 
 
299 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0410042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0517  gluconolactonase  28.77 
 
 
311 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  30.91 
 
 
280 aa  105  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0358  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.46 
 
 
305 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.0997512 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  30.36 
 
 
296 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.17 
 
 
290 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3209  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.04 
 
 
301 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0193044 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.18 
 
 
291 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2637  senescence marker protein-30 family protein  28.14 
 
 
290 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0164591  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5444  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 
295 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00122  regucalcin  29.23 
 
 
303 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.11 
 
 
300 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724481  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1143  gluconolactonase  29.68 
 
 
311 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1058  senescence marker protein-30 family protein  29.68 
 
 
311 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  28.52 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2356  senescence marker protein-30 family protein  29.68 
 
 
311 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>