64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1253 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1253  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  920    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.325224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1941  hypothetical protein  39.91 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0907  hypothetical protein  41.63 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.68427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3838  hypothetical protein  39.67 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1112  hypothetical protein  40.93 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08450  hypothetical protein  41.13 
 
 		 422 aa  309  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1362  hypothetical protein  38.64 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1497  hypothetical protein  38.73 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1720  hypothetical protein  37.3 
 
 		 432 aa  293  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26756  normal  0.377885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2914  hypothetical protein  38.73 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1610  hypothetical protein  26.54 
 
 		 423 aa  156  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640568  unclonable  5.93437e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  24.79 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  29.77 
 
 		 468 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1771  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  26.41 
 
 		 740 aa  73.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0089  hypothetical protein  23.82 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.678836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  22.12 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.77 
 
 		 420 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1375  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  31.88 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0154864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2808  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  36.76 
 
 		 1097 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44400  predicted protein  31.13 
 
 		 2012 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251659  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1064  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  27.41 
 
 		 485 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000351305  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1710  carbamoyl phosphate synthase large subunit  37.68 
 
 		 1136 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1321  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  36.23 
 
 		 1109 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.149141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1298  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  36.23 
 
 		 1093 aa  47.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0243124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1999  carbamoyl phosphate synthase large subunit  33.33 
 
 		 1109 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000570089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4206  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  36.23 
 
 		 1077 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  22 
 
 		 405 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  34.78 
 
 		 1099 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3198  carbamoyl phosphate synthase large subunit  37.68 
 
 		 1130 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00397433  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10656  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 		 795 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.426942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  22.91 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0917  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  32.5 
 
 		 1131 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2272  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  36.23 
 
 		 1030 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2118  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.86 
 
 		 1077 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3102  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  34.78 
 
 		 1100 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2208  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.86 
 
 		 1077 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12580  carbamoyl phosphate synthase large subunit  33.33 
 
 		 1101 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0991038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3012  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  35.29 
 
 		 1107 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.541011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  38.24 
 
 		 1099 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2072  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.86 
 
 		 1083 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.471557 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  38.24 
 
 		 1099 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3132  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  33.33 
 
 		 1101 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1729  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.86 
 
 		 1077 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12690  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  31.88 
 
 		 1118 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359466  normal  0.0639836 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2572  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  32.89 
 
 		 1073 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0164695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1355  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  35.29 
 
 		 1092 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0316249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1846  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  34.78 
 
 		 1111 aa  44.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.422098 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0779  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0393  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.74 
 
 		 1080 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.803496  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0452  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.74 
 
 		 1080 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3001  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  34.78 
 
 		 1104 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105986  normal  0.458872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3514  carbamoyl phosphate synthase large subunit  36.36 
 
 		 1067 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191871  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2550  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  29.89 
 
 		 1067 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2678  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  29.89 
 
 		 1067 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1712  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  33.33 
 
 		 1126 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00812238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00086  carbamoyl phosphate synthase large subunit  33.33 
 
 		 1080 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2955  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  31.71 
 
 		 484 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11413  carbamoyl phosphate synthase large subunit  31.88 
 
 		 1115 aa  43.5  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00750159  normal  0.0530566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0571  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  30.43 
 
 		 1094 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0916  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  33.33 
 
 		 1038 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.150361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2038  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  33.33 
 
 		 1109 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2456  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  30.43 
 
 		 1096 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0679  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  33.82 
 
 		 1095 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1849  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  31.88 
 
 		 1115 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>