26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2914 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2914  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  869    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1362  hypothetical protein  49.88 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08450  hypothetical protein  51.43 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0907  hypothetical protein  45.97 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.68427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1941  hypothetical protein  40.76 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1112  hypothetical protein  42.02 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3838  hypothetical protein  40.76 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1253  hypothetical protein  38.73 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.325224 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1497  hypothetical protein  38.57 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1720  hypothetical protein  36.36 
 
 		 432 aa  273  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26756  normal  0.377885 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  25.41 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  30.97 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1610  hypothetical protein  24.07 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640568  unclonable  5.93437e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1771  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  24 
 
 		 740 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.44 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  28.03 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.36 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  23.93 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.93 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  26.16 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3514  carbamoyl phosphate synthase large subunit  42.59 
 
 		 1067 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.17 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5266  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  32.64 
 
 		 677 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3603  carbamoyl phosphate synthase large subunit  40.74 
 
 		 1067 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  40.74 
 
 		 1067 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0247546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0661  carbamoyl phosphate synthase large subunit  38.89 
 
 		 1066 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00149325  normal  0.138255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>