60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2084 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2084  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  741    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0903485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0837  hypothetical protein  62.05 
 
 		 363 aa  455  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  36.41 
 
 		 396 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0029  protein of unknown function DUF201  31.03 
 
 		 386 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2111  D-alanine--D-alanine ligase  28.49 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0787  D-alanine--D-alanine ligase  28.49 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  0.289278 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0697  D-alanine--D-alanine ligase  30.11 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.389866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  29.58 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1370  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.97 
 
 		 1095 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.06 
 
 		 1071 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.54 
 
 		 1042 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  28.12 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3357  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.19 
 
 		 1112 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  30.69 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.54 
 
 		 1074 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.94 
 
 		 1057 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.42 
 
 		 1079 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4057  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.62 
 
 		 1113 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.84 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  27.08 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  25.77 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3660  D-alanine--D-alanine ligase  31.31 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  23.24 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0679  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.7 
 
 		 1095 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 322 aa  47  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  21.31 
 
 		 321 aa  46.6  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.34 
 
 		 1040 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.79 
 
 		 1057 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.79 
 
 		 1057 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.49 
 
 		 1065 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12690  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.9 
 
 		 1118 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359466  normal  0.0639836 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  27.36 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  23.83 
 
 		 704 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  24.5 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  25.38 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  31.68 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  26.32 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  28.22 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  26.11 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2563  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.83 
 
 		 1056 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  24 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  25.64 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  26.63 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.08 
 
 		 1072 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  23.6 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  28.28 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.45 
 
 		 1082 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2352  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.35 
 
 		 1074 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0604  D-alanine--D-alanine ligase  29.47 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  24.63 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1504  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.5 
 
 		 1049 aa  43.5  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000277903  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0686  D-alanine--D-alanine ligase  29.82 
 
 		 306 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  decreased coverage  0.000224556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1784  D-alanine--D-alanine ligase  25.88 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.65 
 
 		 1062 aa  43.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2446  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.23 
 
 		 1106 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04365  D-alanine--D-alanine ligase  26.67 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2887  D-alanine--D-alanine ligase  27.5 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3173  D-alanine--D-alanine ligase  30.3 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0466065  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2946  D-alanine--D-alanine ligase  30.3 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>