116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4856 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 396 aa  810    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0029  protein of unknown function DUF201  47.94 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2084  hypothetical protein  36.41 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0903485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0837  hypothetical protein  34.66 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.22 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  26.07 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  26.4 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.56 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  24.34 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.26 
 
 		 723 aa  57  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  23.04 
 
 		 312 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24.67 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07561  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  25.38 
 
 		 396 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  26.98 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  26.63 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  19.74 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.21 
 
 		 1082 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.44 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1014  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.9 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  23.81 
 
 		 327 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.09 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4698  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.32 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1302  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23 
 
 		 1082 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  24.64 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  25 
 
 		 543 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  26.42 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0683  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  22.31 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.48 
 
 		 891 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  26.88 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0473  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  26.77 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0397466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.02 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4285  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.27 
 
 		 1105 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0488  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  26.19 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.42 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  26.45 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  24.11 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0761  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  20.99 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  27.1 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  23.65 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07996  D-alanylalanine synthetase  21.79 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.6 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.6 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  25.5 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.02 
 
 		 1065 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4206  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.83 
 
 		 1077 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  27.01 
 
 		 291 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.17 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1473  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  26.7 
 
 		 666 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10083  pyruvate carboxylase  24.65 
 
 		 1150 aa  47  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.667166  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  26.17 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10931  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.54 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.673369  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12301  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.67 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.795061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2669  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.1 
 
 		 1069 aa  46.6  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  26.95 
 
 		 447 aa  46.6  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  21.45 
 
 		 423 aa  46.2  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0503  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.67 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333912  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.61 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0421  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  22.89 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1386  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  25.68 
 
 		 752 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  27.47 
 
 		 1203 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10891  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.47 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.402968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  24.6 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  26.83 
 
 		 1205 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.79 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2242  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.38 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  24.26 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  26.14 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01910  methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1, putative  26.19 
 
 		 733 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254209  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  23.91 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1358  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  27.11 
 
 		 680 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.410164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  24.12 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  27.81 
 
 		 900 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3891  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.16 
 
 		 525 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2446  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.86 
 
 		 1106 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  27.44 
 
 		 1233 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5270  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  26.32 
 
 		 665 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1439  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  24.68 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350388  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10931  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.08 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224699  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.03 
 
 		 1071 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.68 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  23.1 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  24.39 
 
 		 1204 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  24.47 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.67 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  23.44 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  27.81 
 
 		 914 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  20.68 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.03 
 
 		 1062 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  27.81 
 
 		 900 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07361  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  20.55 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  25.87 
 
 		 325 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  23.56 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  30.16 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1404  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  26.17 
 
 		 733 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000354677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6412  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  24.63 
 
 		 656 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792756  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3760  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  26.25 
 
 		 662 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.89 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.61 
 
 		 1064 aa  43.9  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07381  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  22.88 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.210398  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  26.84 
 
 		 1157 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>