213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3289 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 361 aa  711    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  32.63 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  30.16 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  23.31 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.86 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  32.11 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  34.67 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  31.42 
 
 		 484 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  27.52 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  35.62 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  26.04 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  32.72 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.79 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.14 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  34.91 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  27.03 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.61 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  32.76 
 
 		 325 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  27.17 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.68 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.64 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  28.1 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  27.69 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.36 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  26.16 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.75 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  24.01 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  30.53 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2456  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.07 
 
 		 1096 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0060  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.32 
 
 		 1065 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0342  protein of unknown function DUF201  32.7 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42572  Carbamoyl-phosphate synthase L chain  27.21 
 
 		 1105 aa  61.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0674343 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 		 677 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1729  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.62 
 
 		 1077 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2208  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.62 
 
 		 1077 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  26.82 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2118  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.62 
 
 		 1077 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2072  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.91 
 
 		 1083 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.471557 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.21 
 
 		 1064 aa  56.2  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1276  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.17 
 
 		 1081 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104945  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0911  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.27 
 
 		 1081 aa  56.2  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  31.22 
 
 		 914 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1879  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.36 
 
 		 1110 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  31.22 
 
 		 900 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3031  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.55 
 
 		 1084 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.144026  decreased coverage  0.0049366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1774  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.17 
 
 		 1081 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000157385  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  28.29 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.89 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  24 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1052  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.44 
 
 		 1074 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022294 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3525  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.44 
 
 		 1074 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3304  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.44 
 
 		 1074 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3400  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.44 
 
 		 1074 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0966  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.15 
 
 		 1074 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1004  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.15 
 
 		 1074 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.777466  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3577  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.44 
 
 		 1072 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.108884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0968  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.15 
 
 		 1074 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13230  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.86 
 
 		 1093 aa  52.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.94923  normal  0.975818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2939  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.8 
 
 		 1074 aa  52.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1142  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.8 
 
 		 1074 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3211  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.61 
 
 		 1082 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.01 
 
 		 1082 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3074  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.44 
 
 		 1073 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  30.69 
 
 		 900 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3403  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.44 
 
 		 1072 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000056188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2639  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.55 
 
 		 1105 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  21.95 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  27.81 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0320  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.26 
 
 		 1078 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000336143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0085  carbamoylphosphate synthase large subunit  24.03 
 
 		 1127 aa  51.2  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  27.76 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.51 
 
 		 1065 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.44 
 
 		 1082 aa  50.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1732  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.39 
 
 		 1076 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.31 
 
 		 1082 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2313  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.48 
 
 		 1079 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.417995  normal  0.014378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5476  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.04 
 
 		 1073 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783479  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42930  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.83 
 
 		 1073 aa  50.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2079  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.48 
 
 		 1082 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0359545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2524  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.79 
 
 		 1078 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0237548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3358  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25 
 
 		 1072 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.06 
 
 		 1107 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.51 
 
 		 1065 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2550  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.87 
 
 		 1067 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1900  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.31 
 
 		 1082 aa  49.3  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00662116  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0711  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.39 
 
 		 1097 aa  49.7  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0985  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.06 
 
 		 1106 aa  49.3  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.557617  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2678  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.87 
 
 		 1067 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62910  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.69 
 
 		 1073 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.76 
 
 		 1059 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2503  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.73 
 
 		 1076 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3357  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.8 
 
 		 1112 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0121  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.65 
 
 		 1075 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  39.51 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0709  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.04 
 
 		 1073 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4724  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.69 
 
 		 1073 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0333  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.74 
 
 		 1087 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.639877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0976  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.09 
 
 		 1073 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  22.99 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3620  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.35 
 
 		 1073 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.830394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>