163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2618 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  100 
 
 		 387 aa  794    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  21.76 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  24.68 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  26.41 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  21.79 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  20.32 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  24.23 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  24.09 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  21.85 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  25.85 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  19.74 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  22.68 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  19.87 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  22.59 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  20.68 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  23.79 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  23.63 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  21.18 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  22.81 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  22.99 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  25.39 
 
 		 734 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  21.97 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  24.8 
 
 		 333 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  24.14 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  21.28 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  21.85 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  21.68 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  23.86 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  24.49 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  23.32 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  24.54 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.41 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  26.76 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  26.6 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  19.37 
 
 		 513 aa  57  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  23.12 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  24.84 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  20.7 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  20.25 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  19.86 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  25.93 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  19.68 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  23.05 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  26.61 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  19.61 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.97 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0352  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.35 
 
 		 1075 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000999114  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  20.51 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  25.71 
 
 		 415 aa  52.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3603  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.21 
 
 		 1067 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3514  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.98 
 
 		 1067 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  19.37 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1446  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.99 
 
 		 1066 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.63 
 
 		 1067 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0247546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  20.28 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  20.28 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  22.58 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0124  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.27 
 
 		 938 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  20.28 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  21.53 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.05 
 
 		 1040 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  19.93 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.42 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0085  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.84 
 
 		 1056 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00260745  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  21.33 
 
 		 351 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  28.09 
 
 		 525 aa  49.7  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  19.81 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2214  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.36 
 
 		 1072 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0834  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.14 
 
 		 1053 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.249678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1852  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.78 
 
 		 1072 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  20.62 
 
 		 458 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  22.99 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2838  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.53 
 
 		 1073 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2001  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.32 
 
 		 946 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.890669  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.93 
 
 		 1099 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  26.11 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.61 
 
 		 1099 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  23.47 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2319  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.87 
 
 		 1056 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2750  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.66 
 
 		 1120 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4534  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.14 
 
 		 1067 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0939  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.05 
 
 		 1068 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.245842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1254  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.36 
 
 		 1074 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.179154  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  25.17 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2313  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.51 
 
 		 1079 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.417995  normal  0.014378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4285  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.01 
 
 		 1105 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0615  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.53 
 
 		 1064 aa  47.8  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.120313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.71 
 
 		 1089 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02243  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.29 
 
 		 1073 aa  46.6  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1587  pyruvate carboxylase subunit A  22.65 
 
 		 493 aa  46.2  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0911  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.52 
 
 		 1081 aa  46.2  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  21.45 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0222  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.95 
 
 		 1073 aa  45.4  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.256001  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.45 
 
 		 1064 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.68 
 
 		 1059 aa  45.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.13 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0283  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.19 
 
 		 1053 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.85267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.73 
 
 		 1074 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  20.76 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  22.91 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>