47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06110 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  100 
 
 		 421 aa  872    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  48.36 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  47.85 
 
 		 441 aa  360  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  44.15 
 
 		 419 aa  349  5e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  44.15 
 
 		 415 aa  325  8.000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  42.57 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  39.76 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  37.62 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  36.67 
 
 		 753 aa  258  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  31.02 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  34.92 
 
 		 443 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  29.35 
 
 		 408 aa  186  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  29.14 
 
 		 413 aa  183  6e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  29.18 
 
 		 443 aa  176  8e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  24.46 
 
 		 414 aa  160  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  23.37 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  25 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  26.2 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  25.99 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  20.74 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  23.03 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  25 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  27.18 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  22.71 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  22.91 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  23.74 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0333  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.66 
 
 		 1087 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.639877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  25.69 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1562  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.79 
 
 		 1077 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.85 
 
 		 1082 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  22.08 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  24.35 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  25.31 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  24.35 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  22.84 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  21.95 
 
 		 354 aa  46.6  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.6 
 
 		 1059 aa  46.6  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1670  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.1 
 
 		 1078 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809225 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  22.91 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  25.36 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.85 
 
 		 1075 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0911  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.12 
 
 		 1081 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1775  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.18 
 
 		 1073 aa  43.5  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0103005  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.76 
 
 		 1107 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3577  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.98 
 
 		 1072 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.108884 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  29.81 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3357  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.54 
 
 		 1112 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>