97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2881 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  100 
 
 
399 aa  808    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  32.63 
 
 
385 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  29.62 
 
 
408 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  29.41 
 
 
411 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  30.18 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  28.68 
 
 
410 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  26.56 
 
 
391 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  26.46 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  25.71 
 
 
405 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  26.43 
 
 
405 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  24.68 
 
 
418 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  29.06 
 
 
400 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  23.81 
 
 
404 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  26.09 
 
 
434 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  24.29 
 
 
427 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  26.5 
 
 
408 aa  97.1  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  29.71 
 
 
346 aa  94  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  24.84 
 
 
349 aa  94  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  24.09 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  26.42 
 
 
339 aa  90.9  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  25.94 
 
 
443 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  27 
 
 
428 aa  87  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  24.18 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  22.44 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  22.94 
 
 
467 aa  83.2  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  24.63 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  21.88 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  23.05 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  25.09 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  22.89 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  21.07 
 
 
695 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  25 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  23.17 
 
 
753 aa  73.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  19.88 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  22.38 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  25.44 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  22.55 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  19.93 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  24.8 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  23.97 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  24.22 
 
 
440 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  28.35 
 
 
525 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  22.04 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  25 
 
 
443 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  21.33 
 
 
322 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  21.94 
 
 
439 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  23.32 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  25.1 
 
 
418 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  21.79 
 
 
325 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  25.86 
 
 
734 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  19.82 
 
 
333 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0534  hypothetical protein  22.63 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  22.59 
 
 
419 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  23.84 
 
 
321 aa  54.3  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  25.12 
 
 
318 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.19 
 
 
1082 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.88 
 
 
1059 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  24.63 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1281  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.45 
 
 
1074 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  24.63 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  24.14 
 
 
318 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.26 
 
 
322 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  22.71 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 
1062 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.99 
 
 
1075 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0008  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.6 
 
 
1080 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196188  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.15 
 
 
1065 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1257  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.88 
 
 
1072 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  19.94 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1254  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.53 
 
 
1074 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.179154  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.68 
 
 
1059 aa  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3713  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.88 
 
 
1072 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.55 
 
 
1071 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  21.82 
 
 
391 aa  47  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.45 
 
 
1057 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  20.96 
 
 
430 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  22.61 
 
 
313 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.45 
 
 
1057 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  19.71 
 
 
1089 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2138  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.65 
 
 
1085 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0923584 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.89 
 
 
1057 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0243  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  20.9 
 
 
558 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.54 
 
 
1067 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  21.54 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  26.72 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.26 
 
 
1060 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3153  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22 
 
 
1105 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184389 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.01 
 
 
1064 aa  44.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4016  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  19.21 
 
 
1065 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  21.74 
 
 
337 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2446  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  20.93 
 
 
1106 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2127  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.18 
 
 
1086 aa  44.3  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1012  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  19.42 
 
 
1079 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.15 
 
 
1065 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2484  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.85 
 
 
1063 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3984  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.05 
 
 
1072 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2352  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.4 
 
 
1074 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>