95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1936 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  100 
 
 		 414 aa  861    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  53.03 
 
 		 443 aa  443  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  45.95 
 
 		 408 aa  368  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  41.49 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  33.33 
 
 		 426 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  29.14 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  25.12 
 
 		 413 aa  183  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  26.25 
 
 		 415 aa  179  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  28.4 
 
 		 441 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  25.67 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  24.46 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  26.01 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  25.13 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  27.74 
 
 		 424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  28.24 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  28.05 
 
 		 753 aa  146  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  25.63 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  24.63 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  24.71 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  23.11 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  24.68 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  24.05 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  22.15 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  21.72 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  23.76 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  25.82 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  24.19 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  21.52 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  23.4 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2678  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.29 
 
 		 1067 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2550  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.29 
 
 		 1067 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.15 
 
 		 1062 aa  53.5  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.97 
 
 		 1082 aa  53.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15590  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.42 
 
 		 1111 aa  53.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  22.12 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.71 
 
 		 950 aa  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.964164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  21.55 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2572  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  22.69 
 
 		 1073 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0164695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  24.78 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0615  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.56 
 
 		 1064 aa  49.7  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.120313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0613  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.04 
 
 		 1073 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.438109  normal  0.344128 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.15 
 
 		 1064 aa  48.9  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4605  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.31 
 
 		 1109 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.709642  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1852  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.59 
 
 		 1072 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0393  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.65 
 
 		 1080 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.803496  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1516  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.85 
 
 		 1109 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0452  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.65 
 
 		 1080 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5241  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.29 
 
 		 1099 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1457  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.85 
 
 		 1109 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4931  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.01 
 
 		 1052 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324611 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.22 
 
 		 1064 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.26 
 
 		 1075 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3211  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.37 
 
 		 1082 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0833  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.69 
 
 		 1086 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00324716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1446  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.48 
 
 		 1066 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2079  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.25 
 
 		 1082 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0359545  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0479  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.54 
 
 		 1075 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  27.27 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2319  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1056 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.74 
 
 		 1059 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.29 
 
 		 1040 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2617  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.25 
 
 		 1082 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3603  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.76 
 
 		 1067 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.29 
 
 		 1042 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2390  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.25 
 
 		 1053 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1775  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.81 
 
 		 1080 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1458  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.25 
 
 		 1083 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2070  carbamoyl phosphate synthase large subunit  18.56 
 
 		 1029 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.22 
 
 		 1067 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0247546  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0869  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.08 
 
 		 1107 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292684  normal  0.18024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3514  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.22 
 
 		 1067 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3911  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.4 
 
 		 1066 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.123492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2611  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.81 
 
 		 1056 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0243  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  21.01 
 
 		 558 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1096  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.47 
 
 		 1080 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.528087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2838  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.82 
 
 		 1073 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2313  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.29 
 
 		 1079 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.417995  normal  0.014378 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1120  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  22.52 
 
 		 554 aa  43.9  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3713  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.13 
 
 		 1072 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1732  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.37 
 
 		 1076 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  21.53 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0467  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.23 
 
 		 1061 aa  43.5  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0541  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.78 
 
 		 1066 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1257  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.36 
 
 		 1072 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.64 
 
 		 1099 aa  43.1  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0661  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.18 
 
 		 1066 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00149325  normal  0.138255 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1775  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.42 
 
 		 1073 aa  43.1  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0103005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  21.5 
 
 		 637 aa  43.1  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1281  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.03 
 
 		 1074 aa  43.5  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2476  carbamoyl phosphate synthase large subunit  19.23 
 
 		 947 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0099  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.5 
 
 		 951 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.217171  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1295  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.76 
 
 		 1151 aa  43.1  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0925  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.59 
 
 		 939 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.49458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1350  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.12 
 
 		 1086 aa  43.1  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.501423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>