64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2070 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 355 aa  729    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  63.76 
 
 		 356 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  63.2 
 
 		 356 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  62.92 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  37.43 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  27.54 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  25.12 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  25.12 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  25.12 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  25.12 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  21.05 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  23.69 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  23.17 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  24.64 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  28.19 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  22.37 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  24.84 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  23.46 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  28.33 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  29.55 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  23.91 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  28.78 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  25 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  26.17 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  26.36 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.31 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  21.79 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  21.62 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  26.29 
 
 		 428 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  23.61 
 
 		 404 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  24.53 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  24.78 
 
 		 414 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  26.47 
 
 		 423 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.27 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  25.69 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  22 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  21.33 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  23.81 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  24.1 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  22.5 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  22.39 
 
 		 513 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  22.57 
 
 		 458 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  24.07 
 
 		 484 aa  47.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.06 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.3 
 
 		 320 aa  47  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  25.71 
 
 		 323 aa  46.6  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.15 
 
 		 1063 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  25.13 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1116  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  23.5 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  33.77 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.75 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  23.67 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  25.25 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.96 
 
 		 423 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  25.77 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  22.8 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.67 
 
 		 354 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  20.99 
 
 		 327 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  32.47 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.24 
 
 		 1072 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0661  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.57 
 
 		 1066 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00149325  normal  0.138255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  24.49 
 
 		 290 aa  42.7  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  24.65 
 
 		 430 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0870  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.11 
 
 		 1087 aa  42.7  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>