83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0711 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  99.44 
 
 		 356 aa  722    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  726    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  82.58 
 
 		 356 aa  609  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  63.2 
 
 		 355 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  36.69 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  26.64 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  25.94 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  27.56 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  25.89 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  23.47 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  23.94 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  23.94 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  23.94 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  22.4 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  28.33 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  29.3 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  30.22 
 
 		 441 aa  65.9  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  25.12 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  24.41 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  23.51 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  26.72 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  20.91 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  27.05 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  23.17 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  20 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  27.64 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  23.78 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  26.47 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  24.77 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  25.33 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.27 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  22.94 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  22.48 
 
 		 351 aa  52.8  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  25.93 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  22.53 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  27.13 
 
 		 525 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  25.26 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  23.38 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  23.41 
 
 		 513 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  23.13 
 
 		 390 aa  49.7  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  27.43 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  23.56 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  26.2 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.65 
 
 		 1496 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  24.35 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  25.91 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  26.32 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2153  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  25.43 
 
 		 643 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  22.32 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  27.01 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0099  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.49 
 
 		 951 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.217171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  23.58 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.29 
 
 		 423 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  25.71 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0765  pyruvate carboxylase  23.92 
 
 		 1154 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  26.83 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2090  pyruvate carboxylase  23.92 
 
 		 1154 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  26.94 
 
 		 429 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  25.36 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  26.43 
 
 		 430 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  24.15 
 
 		 366 aa  46.2  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3760  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  36.84 
 
 		 662 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1638  pyruvate carboxylase  23.94 
 
 		 1167 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  24.9 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  25.65 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2669  pyruvate carboxylase  23.71 
 
 		 1164 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.22 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  30.3 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3329  pyruvate carboxylase  22.84 
 
 		 1158 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  21.78 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  32.61 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  24.79 
 
 		 399 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5521  pyruvate carboxylase  23.31 
 
 		 1173 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0342  protein of unknown function DUF201  25.47 
 
 		 302 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4144  pyruvate carboxylase  29.03 
 
 		 1144 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  32.61 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3851  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  25.11 
 
 		 704 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.551732  normal  0.392028 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0794  pyruvate carboxylase subunit A  32.04 
 
 		 499 aa  43.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  26.81 
 
 		 428 aa  42.7  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.4 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5754  pyruvate carboxylase  23.31 
 
 		 1169 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0677  pyruvate carboxylase  25.54 
 
 		 1154 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>