More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5754 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04462  pyruvate carboxylase (Eurofung)  45.89 
 
 		 1196 aa  973    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2428  pyruvate carboxylase  54.66 
 
 		 1148 aa  1277    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0297637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  58.33 
 
 		 1145 aa  1385    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3114  pyruvate carboxylase  55.23 
 
 		 1148 aa  1270    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0704  pyruvate carboxylase  49.57 
 
 		 1147 aa  1164    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1190  pyruvate carboxylase  50.99 
 
 		 1148 aa  1202    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0765  pyruvate carboxylase  58.65 
 
 		 1154 aa  1373    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3994  pyruvate carboxylase  50.9 
 
 		 1148 aa  1202    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.882525  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1196  pyruvate carboxylase  49.44 
 
 		 1150 aa  1151    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09250  pyruvate carboxylase  47.9 
 
 		 1127 aa  982    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.582484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4375  pyruvate carboxylase  61.01 
 
 		 1153 aa  1435    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1781  pyruvate carboxylase  61.46 
 
 		 1158 aa  1453    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4167  pyruvate carboxylase  59.23 
 
 		 1154 aa  1409    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1923  pyruvate carboxylase  48.32 
 
 		 1128 aa  983    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30519  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  46.32 
 
 		 1252 aa  1004    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2165  pyruvate carboxylase  48.12 
 
 		 1145 aa  971    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3859  pyruvate carboxylase  50.99 
 
 		 1148 aa  1202    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12982  pyruvate carboxylase  47.6 
 
 		 1127 aa  949    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3839  pyruvate carboxylase  59.74 
 
 		 1154 aa  1415    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3690  pyruvate carboxylase  51.07 
 
 		 1148 aa  1205    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3139  pyruvate carboxylase  60.65 
 
 		 1184 aa  1431    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1716  pyruvate carboxylase  61.46 
 
 		 1158 aa  1453    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3707  pyruvate carboxylase  51.07 
 
 		 1148 aa  1206    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.863258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0273  pyruvate carboxylase  54.1 
 
 		 1148 aa  1243    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.322255  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18300  pyruvate carboxylase  48.63 
 
 		 1134 aa  959    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.154517 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00650  pyruvate carboxylase, putative  47.49 
 
 		 1103 aa  926    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.242761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2995  pyruvate carboxylase  55.96 
 
 		 1149 aa  1282    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1751  pyruvate carboxylase  49.78 
 
 		 1124 aa  989    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1989  pyruvate carboxylase  48.03 
 
 		 1131 aa  973    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49339  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  47.13 
 
 		 1264 aa  1012    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1336  pyruvate carboxylase  54.18 
 
 		 1148 aa  1247    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.441133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4717  pyruvate carboxylase  86.59 
 
 		 1169 aa  2024    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2669  pyruvate carboxylase  60.95 
 
 		 1164 aa  1433    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10083  pyruvate carboxylase  48.54 
 
 		 1150 aa  1158    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.667166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1877  pyruvate carboxylase  46.8 
 
 		 1138 aa  898    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010898  normal  0.0198778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13810  pyruvate carboxylase  46.2 
 
 		 1172 aa  922    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3773  pyruvate carboxylase  50.56 
 
 		 1148 aa  1197    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.333  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0402  pyruvate carboxylase  58.87 
 
 		 1147 aa  1369    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32964  predicted protein  44.72 
 
 		 1132 aa  924    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0171502  normal  0.395627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4198  pyruvate carboxylase  47.78 
 
 		 1148 aa  969    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.721945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5973  pyruvate carboxylase  47.47 
 
 		 1125 aa  977    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2090  pyruvate carboxylase  58.57 
 
 		 1154 aa  1372    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0677  pyruvate carboxylase  58.13 
 
 		 1154 aa  1379    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418471 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1957  pyruvate carboxylase  53.79 
 
 		 1148 aa  1217    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6501  pyruvate carboxylase  49.18 
 
 		 1127 aa  928    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.697042 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7328  pyruvate carboxylase  95.18 
 
 		 1172 aa  2263    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4065  pyruvate carboxylase  50.9 
 
 		 1148 aa  1201    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  53.36 
 
 		 1147 aa  1253    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1298  pyruvate carboxylase  47.58 
 
 		 1132 aa  951    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.936184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0816  pyruvate carboxylase  53.45 
 
 		 1148 aa  1253    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000167673  hitchhiker  0.00000000644662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5521  pyruvate carboxylase  98.97 
 
 		 1173 aa  2371    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0258  pyruvate carboxylase  54.18 
 
 		 1148 aa  1243    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000175777 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90975  Pyruvate carboxylase  45.52 
 
 		 1179 aa  982    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.301663  normal  0.518395 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4157  pyruvate carboxylase  50.99 
 
 		 1148 aa  1202    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2649  pyruvate carboxylase  50.95 
 
 		 1148 aa  1211    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00733169  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  60.31 
 
 		 1157 aa  1439    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4454  pyruvate carboxylase  50.17 
 
 		 1149 aa  1129    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1121  pyruvate carboxylase  63.52 
 
 		 1153 aa  1474    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2317  pyruvate carboxylase  58.49 
 
 		 1146 aa  1346    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2549  pyruvate carboxylase  52.75 
 
 		 1149 aa  1230    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.011252  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0972  pyruvate carboxylase  53.51 
 
 		 1165 aa  1228    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3015  pyruvate carboxylase  54.89 
 
 		 1148 aa  1282    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240304  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0317  pyruvate carboxylase  48.59 
 
 		 1136 aa  926    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.557231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2907  pyruvate carboxylase  53.88 
 
 		 1148 aa  1224    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  52.76 
 
 		 1147 aa  1248    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4050  pyruvate carboxylase  50.82 
 
 		 1148 aa  1199    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.898796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2781  pyruvate carboxylase  57.3 
 
 		 1146 aa  1354    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.34557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2457  pyruvate carboxylase  47.13 
 
 		 1127 aa  993    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300234 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1174  pyruvate carboxylase  49.44 
 
 		 1150 aa  1151    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.810456  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1638  pyruvate carboxylase  85.48 
 
 		 1167 aa  1999    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6118  pyruvate carboxylase  59.62 
 
 		 1165 aa  1412    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.410789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0937  pyruvate carboxylase  46.86 
 
 		 1128 aa  931    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218136  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2028  pyruvate carboxylase  58.88 
 
 		 1146 aa  1382    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4144  pyruvate carboxylase  59.47 
 
 		 1144 aa  1378    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1943  pyruvate carboxylase  48.03 
 
 		 1131 aa  973    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.845538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2041  pyruvate carboxylase  49.74 
 
 		 1128 aa  989    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3962  pyruvate carboxylase  51.07 
 
 		 1148 aa  1204    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1816  pyruvate carboxylase  47.34 
 
 		 1129 aa  974    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3329  pyruvate carboxylase  61.51 
 
 		 1158 aa  1432    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3513  pyruvate carboxylase  47.07 
 
 		 1128 aa  936    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3215  pyruvate carboxylase  55.06 
 
 		 1148 aa  1268    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0519  pyruvate carboxylase  47.94 
 
 		 1144 aa  1147    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1360  pyruvate carboxylase  61.07 
 
 		 1147 aa  1443    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0615601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1142  pyruvate carboxylase  60.07 
 
 		 1146 aa  1432    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0248368  normal  0.044238 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5754  pyruvate carboxylase  100 
 
 		 1169 aa  2393    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1547  pyruvate carboxylase  47.25 
 
 		 1132 aa  942    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.108639 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1152  pyruvate carboxylase  47.13 
 
 		 1126 aa  959    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0696  pyruvate carboxylase  48.15 
 
 		 1137 aa  1115    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1119  pyruvate carboxylase  61.32 
 
 		 1169 aa  1454    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1546  pyruvate carboxylase  47.34 
 
 		 1131 aa  944    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0873  pyruvate carboxylase  32.03 
 
 		 1230 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2308  pyruvate carboxylase  31.17 
 
 		 1229 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0417  pyruvate carboxylase  31.49 
 
 		 1234 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00734861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2160  pyruvate carboxylase  31.23 
 
 		 1229 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0690  pyruvate carboxylase  31.82 
 
 		 1230 aa  452  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775311  normal  0.465507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2081  pyruvate carboxylase  31.16 
 
 		 1238 aa  452  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1328  pyruvate carboxylase  31.05 
 
 		 1234 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1553  pyruvate carboxylase  30.1 
 
 		 1233 aa  429  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0585647  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  45.57 
 
 		 498 aa  425  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1043  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  45.2 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>