More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2308 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1553  pyruvate carboxylase  65.64 
 
 		 1233 aa  1681    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0585647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0873  pyruvate carboxylase  71.24 
 
 		 1230 aa  1795    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0417  pyruvate carboxylase  66.59 
 
 		 1234 aa  1692    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00734861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2081  pyruvate carboxylase  66.24 
 
 		 1238 aa  1687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2160  pyruvate carboxylase  70.24 
 
 		 1229 aa  1784    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1328  pyruvate carboxylase  65.96 
 
 		 1234 aa  1662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0690  pyruvate carboxylase  89.41 
 
 		 1230 aa  2264    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775311  normal  0.465507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2308  pyruvate carboxylase  100 
 
 		 1229 aa  2558    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  30.31 
 
 		 1157 aa  485  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1781  pyruvate carboxylase  30.78 
 
 		 1158 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7328  pyruvate carboxylase  31.2 
 
 		 1172 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1716  pyruvate carboxylase  30.78 
 
 		 1158 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1119  pyruvate carboxylase  30.62 
 
 		 1169 aa  482  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3139  pyruvate carboxylase  30.74 
 
 		 1184 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0972  pyruvate carboxylase  30.46 
 
 		 1165 aa  470  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6118  pyruvate carboxylase  30.42 
 
 		 1165 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.410789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3839  pyruvate carboxylase  30.2 
 
 		 1154 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4167  pyruvate carboxylase  30.52 
 
 		 1154 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1142  pyruvate carboxylase  31.31 
 
 		 1146 aa  472  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0248368  normal  0.044238 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5754  pyruvate carboxylase  31.17 
 
 		 1169 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0696  pyruvate carboxylase  30.67 
 
 		 1137 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5521  pyruvate carboxylase  31.17 
 
 		 1173 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  30.6 
 
 		 1147 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1121  pyruvate carboxylase  30.71 
 
 		 1153 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3329  pyruvate carboxylase  30.88 
 
 		 1158 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3962  pyruvate carboxylase  30.76 
 
 		 1148 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3690  pyruvate carboxylase  30.72 
 
 		 1148 aa  465  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3707  pyruvate carboxylase  30.76 
 
 		 1148 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.863258  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1360  pyruvate carboxylase  31.23 
 
 		 1147 aa  465  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0615601 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  30.82 
 
 		 1147 aa  465  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4065  pyruvate carboxylase  30.76 
 
 		 1148 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3994  pyruvate carboxylase  30.64 
 
 		 1148 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.882525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3859  pyruvate carboxylase  30.76 
 
 		 1148 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4050  pyruvate carboxylase  30.93 
 
 		 1148 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.898796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4157  pyruvate carboxylase  30.76 
 
 		 1148 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1190  pyruvate carboxylase  30.93 
 
 		 1148 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2028  pyruvate carboxylase  29.95 
 
 		 1146 aa  462  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4375  pyruvate carboxylase  29.99 
 
 		 1153 aa  462  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2649  pyruvate carboxylase  30.72 
 
 		 1148 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00733169  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0677  pyruvate carboxylase  30.28 
 
 		 1154 aa  459  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3773  pyruvate carboxylase  30.66 
 
 		 1148 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3015  pyruvate carboxylase  30.68 
 
 		 1148 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240304  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0402  pyruvate carboxylase  30.64 
 
 		 1147 aa  459  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1638  pyruvate carboxylase  31.03 
 
 		 1167 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49339  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  30.83 
 
 		 1264 aa  455  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2090  pyruvate carboxylase  29.83 
 
 		 1154 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1957  pyruvate carboxylase  31.38 
 
 		 1148 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90975  Pyruvate carboxylase  31.34 
 
 		 1179 aa  452  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.301663  normal  0.518395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1336  pyruvate carboxylase  30.61 
 
 		 1148 aa  452  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.441133  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04462  pyruvate carboxylase (Eurofung)  31.8 
 
 		 1196 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  30.03 
 
 		 1145 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0765  pyruvate carboxylase  29.75 
 
 		 1154 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4717  pyruvate carboxylase  30.74 
 
 		 1169 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1923  pyruvate carboxylase  31.09 
 
 		 1128 aa  445  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2995  pyruvate carboxylase  30.53 
 
 		 1149 aa  446  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3215  pyruvate carboxylase  30.39 
 
 		 1148 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2781  pyruvate carboxylase  29.46 
 
 		 1146 aa  442  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.34557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1943  pyruvate carboxylase  31.01 
 
 		 1131 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.845538  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3114  pyruvate carboxylase  30.54 
 
 		 1148 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1989  pyruvate carboxylase  31.01 
 
 		 1131 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4144  pyruvate carboxylase  30.12 
 
 		 1144 aa  439  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1174  pyruvate carboxylase  29.35 
 
 		 1150 aa  439  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.810456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2549  pyruvate carboxylase  30.11 
 
 		 1149 aa  439  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.011252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0519  pyruvate carboxylase  27.83 
 
 		 1144 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1196  pyruvate carboxylase  29.35 
 
 		 1150 aa  439  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0704  pyruvate carboxylase  29.28 
 
 		 1147 aa  435  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1816  pyruvate carboxylase  30.53 
 
 		 1129 aa  436  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0816  pyruvate carboxylase  30.31 
 
 		 1148 aa  436  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000167673  hitchhiker  0.00000000644662 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1298  pyruvate carboxylase  29.84 
 
 		 1132 aa  436  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.936184 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18300  pyruvate carboxylase  31.03 
 
 		 1134 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.154517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2669  pyruvate carboxylase  30.13 
 
 		 1164 aa  432  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4198  pyruvate carboxylase  30.51 
 
 		 1148 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.721945 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10083  pyruvate carboxylase  28.67 
 
 		 1150 aa  423  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.667166  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32964  predicted protein  31.23 
 
 		 1132 aa  424  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0171502  normal  0.395627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4454  pyruvate carboxylase  30.87 
 
 		 1149 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2165  pyruvate carboxylase  30.57 
 
 		 1145 aa  426  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0937  pyruvate carboxylase  29.95 
 
 		 1128 aa  422  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218136  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09250  pyruvate carboxylase  30.57 
 
 		 1127 aa  422  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.582484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2428  pyruvate carboxylase  29.89 
 
 		 1148 aa  416  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0297637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5973  pyruvate carboxylase  30.61 
 
 		 1125 aa  415  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2457  pyruvate carboxylase  30.18 
 
 		 1127 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2317  pyruvate carboxylase  30.26 
 
 		 1146 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13810  pyruvate carboxylase  31.03 
 
 		 1172 aa  408  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2954  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.48 
 
 		 685 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.738213  hitchhiker  0.000297505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0273  pyruvate carboxylase  29.92 
 
 		 1148 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.322255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1547  pyruvate carboxylase  30.14 
 
 		 1132 aa  405  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.108639 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3513  pyruvate carboxylase  30.33 
 
 		 1128 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0258  pyruvate carboxylase  29.48 
 
 		 1148 aa  405  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000175777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2907  pyruvate carboxylase  30.08 
 
 		 1148 aa  406  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1546  pyruvate carboxylase  30.35 
 
 		 1131 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1751  pyruvate carboxylase  30.35 
 
 		 1124 aa  405  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30519  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  29.75 
 
 		 1252 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00650  pyruvate carboxylase, putative  30.58 
 
 		 1103 aa  399  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.242761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1152  pyruvate carboxylase  30.33 
 
 		 1126 aa  399  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2041  pyruvate carboxylase  30.68 
 
 		 1128 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  44.34 
 
 		 498 aa  379  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2591  pyruvate carboxylase subunit A  44.59 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1587  pyruvate carboxylase subunit A  42.8 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2718  pyruvate carboxylase subunit A  44.37 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0984  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  45.37 
 
 		 446 aa  373  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000016105  normal  0.0128167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>