More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2995 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04462  pyruvate carboxylase (Eurofung)  50.48 
 
 
1196 aa  1103    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736357  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  52.95 
 
 
1145 aa  1213    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13810  pyruvate carboxylase  49.66 
 
 
1172 aa  1015    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2428  pyruvate carboxylase  75.46 
 
 
1148 aa  1776    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0297637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6501  pyruvate carboxylase  49.65 
 
 
1127 aa  934    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.697042 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0704  pyruvate carboxylase  53.37 
 
 
1147 aa  1258    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0765  pyruvate carboxylase  52.98 
 
 
1154 aa  1205    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.531635  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4454  pyruvate carboxylase  54.19 
 
 
1149 aa  1240    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3994  pyruvate carboxylase  56.82 
 
 
1148 aa  1340    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.882525  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5521  pyruvate carboxylase  55.96 
 
 
1173 aa  1283    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1196  pyruvate carboxylase  54.28 
 
 
1150 aa  1271    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1781  pyruvate carboxylase  53.67 
 
 
1158 aa  1226    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10083  pyruvate carboxylase  50.31 
 
 
1150 aa  1221    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.667166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1174  pyruvate carboxylase  54.28 
 
 
1150 aa  1271    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.810456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3859  pyruvate carboxylase  56.91 
 
 
1148 aa  1340    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3839  pyruvate carboxylase  52.77 
 
 
1154 aa  1199    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2669  pyruvate carboxylase  54.59 
 
 
1164 aa  1249    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3690  pyruvate carboxylase  56.91 
 
 
1148 aa  1341    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0258  pyruvate carboxylase  73.01 
 
 
1148 aa  1737    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000175777 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1716  pyruvate carboxylase  53.67 
 
 
1158 aa  1226    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3707  pyruvate carboxylase  56.73 
 
 
1148 aa  1337    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.863258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0972  pyruvate carboxylase  55.67 
 
 
1165 aa  1277    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4198  pyruvate carboxylase  48.56 
 
 
1148 aa  1018    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.721945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2457  pyruvate carboxylase  48.21 
 
 
1127 aa  1002    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000300234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1547  pyruvate carboxylase  50.22 
 
 
1132 aa  989    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.108639 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00650  pyruvate carboxylase, putative  49.81 
 
 
1103 aa  1003    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.242761  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09250  pyruvate carboxylase  50.65 
 
 
1127 aa  1068    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.582484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3773  pyruvate carboxylase  56.91 
 
 
1148 aa  1335    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.333  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4717  pyruvate carboxylase  55.71 
 
 
1169 aa  1237    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0937  pyruvate carboxylase  48.65 
 
 
1128 aa  991    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2995  pyruvate carboxylase  100 
 
 
1149 aa  2330    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90975  Pyruvate carboxylase  49.31 
 
 
1179 aa  1083    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.301663  normal  0.518395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4167  pyruvate carboxylase  52.89 
 
 
1154 aa  1203    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2090  pyruvate carboxylase  53.07 
 
 
1154 aa  1208    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1957  pyruvate carboxylase  66.52 
 
 
1148 aa  1569    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30519  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  48.67 
 
 
1252 aa  1053    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7328  pyruvate carboxylase  56.09 
 
 
1172 aa  1281    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1190  pyruvate carboxylase  56.99 
 
 
1148 aa  1339    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6118  pyruvate carboxylase  52.99 
 
 
1165 aa  1197    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.410789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1119  pyruvate carboxylase  54.19 
 
 
1169 aa  1229    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1298  pyruvate carboxylase  49.65 
 
 
1132 aa  1036    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.936184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0816  pyruvate carboxylase  74.74 
 
 
1148 aa  1778    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000167673  hitchhiker  0.00000000644662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18300  pyruvate carboxylase  49.7 
 
 
1134 aa  1007    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.154517 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49339  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  49.7 
 
 
1264 aa  1080    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1989  pyruvate carboxylase  48.34 
 
 
1131 aa  1007    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12982  pyruvate carboxylase  48.82 
 
 
1127 aa  980    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4157  pyruvate carboxylase  56.91 
 
 
1148 aa  1340    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1360  pyruvate carboxylase  54.26 
 
 
1147 aa  1235    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0615601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1877  pyruvate carboxylase  48.66 
 
 
1138 aa  959    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010898  normal  0.0198778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1121  pyruvate carboxylase  53.7 
 
 
1153 aa  1217    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2317  pyruvate carboxylase  53.26 
 
 
1146 aa  1161    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3962  pyruvate carboxylase  56.82 
 
 
1148 aa  1341    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  58.78 
 
 
1147 aa  1383    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32964  predicted protein  48.67 
 
 
1132 aa  1030    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0171502  normal  0.395627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3015  pyruvate carboxylase  87.28 
 
 
1148 aa  2063    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240304  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0317  pyruvate carboxylase  49.31 
 
 
1136 aa  948    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.557231  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3513  pyruvate carboxylase  50.04 
 
 
1128 aa  1003    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3114  pyruvate carboxylase  87.63 
 
 
1148 aa  2037    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558705  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2781  pyruvate carboxylase  53.18 
 
 
1146 aa  1223    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.34557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1816  pyruvate carboxylase  48.03 
 
 
1129 aa  996    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0273  pyruvate carboxylase  72.84 
 
 
1148 aa  1729    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.322255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1152  pyruvate carboxylase  50.92 
 
 
1126 aa  1032    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  60.09 
 
 
1147 aa  1404    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0402  pyruvate carboxylase  54.14 
 
 
1147 aa  1205    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1638  pyruvate carboxylase  54.37 
 
 
1167 aa  1192    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2649  pyruvate carboxylase  56.91 
 
 
1148 aa  1348    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00733169  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2028  pyruvate carboxylase  53.87 
 
 
1146 aa  1196    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0677  pyruvate carboxylase  52.85 
 
 
1154 aa  1210    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1943  pyruvate carboxylase  48.34 
 
 
1131 aa  1007    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.845538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2041  pyruvate carboxylase  50.87 
 
 
1128 aa  1027    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1923  pyruvate carboxylase  48.65 
 
 
1128 aa  1016    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4050  pyruvate carboxylase  56.91 
 
 
1148 aa  1339    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.898796  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3329  pyruvate carboxylase  54.03 
 
 
1158 aa  1209    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2907  pyruvate carboxylase  73.08 
 
 
1148 aa  1731    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2549  pyruvate carboxylase  74.04 
 
 
1149 aa  1765    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.011252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3139  pyruvate carboxylase  54.47 
 
 
1184 aa  1231    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4375  pyruvate carboxylase  53.29 
 
 
1153 aa  1188    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0519  pyruvate carboxylase  54.44 
 
 
1144 aa  1339    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3215  pyruvate carboxylase  87.28 
 
 
1148 aa  2030    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1142  pyruvate carboxylase  52.57 
 
 
1146 aa  1218    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0248368  normal  0.044238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2165  pyruvate carboxylase  48.22 
 
 
1145 aa  1001    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5754  pyruvate carboxylase  55.96 
 
 
1169 aa  1283    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345143  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5973  pyruvate carboxylase  50 
 
 
1125 aa  1047    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4065  pyruvate carboxylase  56.82 
 
 
1148 aa  1339    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164116  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0696  pyruvate carboxylase  51.75 
 
 
1137 aa  1207    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4144  pyruvate carboxylase  53.57 
 
 
1144 aa  1198    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1546  pyruvate carboxylase  50.35 
 
 
1131 aa  1004    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  53.77 
 
 
1157 aa  1215    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1751  pyruvate carboxylase  50.65 
 
 
1124 aa  1040    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1336  pyruvate carboxylase  71.15 
 
 
1148 aa  1697    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.441133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1043  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.11 
 
 
476 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0873  pyruvate carboxylase  30.72 
 
 
1230 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1511  pyruvate carboxylase subunit A  50.66 
 
 
472 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473143  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4207  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.67 
 
 
588 aa  445  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2591  pyruvate carboxylase subunit A  47.17 
 
 
471 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1587  pyruvate carboxylase subunit A  48.92 
 
 
493 aa  446  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1351  pyruvate carboxylase subunit A  49.46 
 
 
506 aa  444  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.926439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0676  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.19 
 
 
477 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.068223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2160  pyruvate carboxylase  30.75 
 
 
1229 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1333  pyruvate carboxylase subunit A  48.78 
 
 
497 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>