90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1972 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  696    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  27.39 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  31.07 
 
 
322 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  30.13 
 
 
337 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  31.8 
 
 
404 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  26.05 
 
 
339 aa  99.4  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  30.83 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  27.84 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  29.64 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  24.84 
 
 
399 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.65 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  25.49 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  26.41 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  27.82 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.02 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  27.44 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  29.64 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  27.72 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  27.11 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.35 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  25.36 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  26.54 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  27.36 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.08 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  26.05 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
677 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  25.87 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  28.17 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.56 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  22.22 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0342  protein of unknown function DUF201  32 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  25.95 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  20.78 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  25.91 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  24.43 
 
 
411 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  25.44 
 
 
439 aa  63.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  25.58 
 
 
424 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  25.42 
 
 
408 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  22.15 
 
 
312 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  26.09 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  30.6 
 
 
525 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  24.57 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  26.57 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  24.2 
 
 
284 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  30.25 
 
 
318 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  27.18 
 
 
421 aa  55.8  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  26.47 
 
 
356 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  26.71 
 
 
430 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  23.78 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  23.81 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  28.62 
 
 
443 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  24.21 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  27.62 
 
 
418 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.48 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  24.62 
 
 
423 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  23.66 
 
 
695 aa  53.5  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  25.82 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  25.74 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8506  hypothetical protein  26.54 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  25.31 
 
 
359 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.67 
 
 
418 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.94 
 
 
411 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  25 
 
 
413 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  23.3 
 
 
327 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  23.83 
 
 
408 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  25.75 
 
 
441 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  23.94 
 
 
734 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  24.03 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  27.13 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.26 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  21.21 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1029  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp (A) domain protein  31.21 
 
 
427 aa  47  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  22.9 
 
 
390 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  24.89 
 
 
434 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.16 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0840  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  39.73 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0378417  hitchhiker  0.00000000944832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3132  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.67 
 
 
1101 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  23.68 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0305  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.89 
 
 
1089 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  26.91 
 
 
430 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  25.91 
 
 
753 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1692  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.57 
 
 
1089 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  23.57 
 
 
386 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  22.38 
 
 
415 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  21.74 
 
 
416 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  24.68 
 
 
413 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  35.42 
 
 
319 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.68 
 
 
423 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  34.38 
 
 
319 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.6 
 
 
1082 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>