50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1350 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  100 
 
 
440 aa  883    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  59.65 
 
 
427 aa  459  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  56.11 
 
 
439 aa  426  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  45.74 
 
 
467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  45.04 
 
 
399 aa  295  8e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  60.29 
 
 
525 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  30.43 
 
 
383 aa  149  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  29.7 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  32.14 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  29.86 
 
 
412 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  29.91 
 
 
339 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  26.6 
 
 
346 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  27.48 
 
 
695 aa  97.8  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  26.69 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  25.08 
 
 
393 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  27.81 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  27.47 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  26.33 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  26.65 
 
 
390 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  27.36 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  20.38 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  22.15 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  25.39 
 
 
457 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  24.22 
 
 
399 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  24.47 
 
 
386 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  23.95 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  27.3 
 
 
333 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  24.31 
 
 
327 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  23.59 
 
 
397 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  22.08 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  21.59 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  26.69 
 
 
322 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.56 
 
 
326 aa  53.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  26.38 
 
 
337 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  36.76 
 
 
434 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4422  hypothetical protein  25.6 
 
 
340 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  24.91 
 
 
406 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8506  hypothetical protein  35.14 
 
 
379 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  25.71 
 
 
387 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  29.37 
 
 
387 aa  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  25.71 
 
 
387 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  26.67 
 
 
360 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  25.71 
 
 
387 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  36.76 
 
 
734 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.11 
 
 
324 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  25.1 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  24.48 
 
 
334 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  22.39 
 
 
356 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  23.23 
 
 
421 aa  43.5  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  26.19 
 
 
441 aa  43.1  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>