66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0139 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  824    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  62.18 
 
 		 391 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  28.68 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  29.26 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  29.77 
 
 		 411 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  26.4 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  26.89 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  25.72 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  26.92 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  27.39 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  30.25 
 
 		 434 aa  87.8  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  27.9 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  23.43 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  27.44 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  24.87 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  27.97 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  26.02 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  27.47 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  26.13 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  25.75 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  25.62 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  24.85 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  23.55 
 
 		 695 aa  70.5  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  28.88 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  27.4 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  28.48 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  25.98 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  26.28 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  23.68 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  27.21 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  23.36 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  25.81 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  23.17 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  24.76 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  23.17 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  27.22 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  21.92 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  27.52 
 
 		 333 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  24.36 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  23.74 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  20.58 
 
 		 321 aa  53.9  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  24.37 
 
 		 386 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  24.75 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  24.79 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  24.15 
 
 		 753 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  19.37 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  21.55 
 
 		 414 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  21.89 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  29.06 
 
 		 322 aa  49.7  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  22.59 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  22.78 
 
 		 734 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  23.05 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  23.13 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  23.13 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  23.13 
 
 		 360 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.56 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  24.04 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  24.57 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  24.85 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  24.08 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4534  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.88 
 
 		 1067 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06126  Acetyl-CoA carboxylasePutative uncharacterized protein (EC 6.4.1.2); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O60033]  28.74 
 
 		 2288 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.353835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1317  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  27.6 
 
 		 1811 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468055  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.01 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  34.25 
 
 		 468 aa  43.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  25.46 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>