91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0958 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  100 
 
 		 385 aa  798    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  32.63 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  26.33 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  29.26 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  27.27 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  28.8 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  25.96 
 
 		 408 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  26.5 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  24.73 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  26.63 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  25.61 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  26.38 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  25.43 
 
 		 695 aa  93.2  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  28.12 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  24.29 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  26.04 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  25.36 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  25.39 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  24.71 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  23.25 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  23.25 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  26.42 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  23.88 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  27.87 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  26.98 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  25 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  23.94 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  22.96 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  23.29 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  22.68 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  25.14 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  26.96 
 
 		 753 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  22.43 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  25.81 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  24.67 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  24.22 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  27.04 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  24.14 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  22.78 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  26.54 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  23.64 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  22.53 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  22.15 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  24.57 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  26.07 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2426  D-alanine--D-alanine ligase  26.96 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142396  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  22.88 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  24.17 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  23.22 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  24.64 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  24.17 
 
 		 318 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  25.12 
 
 		 314 aa  57  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  24.17 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  24.17 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  26.8 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  23.7 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  24.17 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  23.7 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  24.16 
 
 		 351 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  22.96 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  24.66 
 
 		 755 aa  50.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  24.25 
 
 		 386 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  22.08 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0534  hypothetical protein  22.91 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  26.67 
 
 		 896 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0597  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  22.61 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  22.49 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  28.95 
 
 		 525 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  25.23 
 
 		 751 aa  46.6  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  24.19 
 
 		 359 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  25.93 
 
 		 327 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.31 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  30.43 
 
 		 878 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  30.43 
 
 		 883 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  25.35 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2090  pyruvate carboxylase  25.87 
 
 		 1154 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  22.77 
 
 		 895 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0765  pyruvate carboxylase  25.87 
 
 		 1154 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  30.21 
 
 		 723 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.07 
 
 		 1082 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  22.79 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  25.96 
 
 		 321 aa  43.9  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  23.17 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  29.35 
 
 		 730 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2028  pyruvate carboxylase  27.64 
 
 		 1146 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0677  pyruvate carboxylase  24.92 
 
 		 1154 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  22.88 
 
 		 894 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  30.21 
 
 		 723 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  24.88 
 
 		 332 aa  42.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  25.5 
 
 		 397 aa  42.7  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  27.32 
 
 		 1145 aa  42.7  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>