25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  100 
 
 		 419 aa  853    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  44.15 
 
 		 421 aa  349  5e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  45.48 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  43.83 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  43.3 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  39.08 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  39.85 
 
 		 418 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  37.68 
 
 		 426 aa  247  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  30.96 
 
 		 753 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  28.46 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  29.56 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  27.96 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  27.03 
 
 		 443 aa  166  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  31.28 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  25.13 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  23.38 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  26.01 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  22.88 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  22.59 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  21.57 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0124  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23 
 
 		 938 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  26.81 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  23.75 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1446  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.56 
 
 		 1066 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2232  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.53 
 
 		 1079 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>