32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6484 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  98.27 
 
 		 405 aa  822    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  100 
 
 		 405 aa  833    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  43.13 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  37.7 
 
 		 400 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  27.51 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  27.54 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  26.43 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  23.25 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  28.84 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  23.05 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  27.11 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  24.05 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  25 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  21.59 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  25.98 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  27.27 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  25.35 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  25.08 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  27.11 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  23.65 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  24.92 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  22.71 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  27.64 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  20.74 
 
 		 443 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  22.99 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  23.97 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  21.65 
 
 		 695 aa  51.2  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  24.21 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  22.19 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  28.29 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  22.02 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  28.37 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>