79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2376 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  822    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  39.65 
 
 		 404 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  37.69 
 
 		 383 aa  222  9e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  33.53 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  30.08 
 
 		 439 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  29.86 
 
 		 404 aa  149  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  31.14 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  31.27 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  29.66 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  30.77 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  29.7 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  31.95 
 
 		 695 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  32.26 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  24.73 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  28.23 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  23.81 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  24.94 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  27.23 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  31.8 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  37.85 
 
 		 525 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  28.22 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  28.99 
 
 		 439 aa  94  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  26.13 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  21.79 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  27.27 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  27.03 
 
 		 413 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  27.97 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  25.77 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  30.71 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  27.04 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  25.57 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  27.04 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8506  hypothetical protein  28.05 
 
 		 379 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  25.71 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  26.2 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  27.5 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  28.14 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  24.83 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  27.27 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  23.69 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  27.27 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  25.11 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  23.79 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  23.47 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  27.1 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  26.25 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.43 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  29.19 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  27.12 
 
 		 434 aa  53.5  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  28.09 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  21.63 
 
 		 326 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  27.08 
 
 		 426 aa  53.1  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4422  hypothetical protein  26.09 
 
 		 340 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  22.97 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  25.17 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  21.9 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  26.25 
 
 		 327 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  27.94 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  23.61 
 
 		 355 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  25.76 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  26.94 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05461  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.1 
 
 		 438 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.958381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  29.32 
 
 		 441 aa  47.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  24.64 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  24.43 
 
 		 318 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0613  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.24 
 
 		 1073 aa  46.6  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.438109  normal  0.344128 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  24.88 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.16 
 
 		 677 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2232  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.54 
 
 		 1079 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  28.3 
 
 		 578 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.54 
 
 		 1082 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  25.36 
 
 		 753 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  25.08 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  20.68 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0352  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1075 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000999114  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  24.14 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  28.57 
 
 		 893 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  20.54 
 
 		 320 aa  43.1  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  28.35 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>