152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16420 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  100 
 
 		 415 aa  844    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  57.49 
 
 		 413 aa  492  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  48.54 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  43.94 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  45.41 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  44.99 
 
 		 418 aa  331  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  44.15 
 
 		 421 aa  325  8.000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  43.83 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  38.01 
 
 		 753 aa  266  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  35.99 
 
 		 428 aa  249  8e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  31.05 
 
 		 408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  31.46 
 
 		 413 aa  219  7.999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  30.27 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  34.89 
 
 		 443 aa  217  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  26.25 
 
 		 414 aa  179  8e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  25.15 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  28.84 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  22.89 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  28.84 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  22.43 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  24.83 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  25.26 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  25.81 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1670  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.42 
 
 		 1078 aa  60.1  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  26.02 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  22.78 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1775  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.15 
 
 		 1073 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0103005  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3603  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.06 
 
 		 1067 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  25.41 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3514  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.19 
 
 		 1067 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4605  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.65 
 
 		 1109 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.709642  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  30.6 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  25.71 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  25.99 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  24.39 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.4 
 
 		 1067 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0247546  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3031  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.81 
 
 		 1084 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.144026  decreased coverage  0.0049366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1516  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.82 
 
 		 1109 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1562  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.66 
 
 		 1077 aa  51.6  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0869  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.53 
 
 		 1107 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292684  normal  0.18024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2214  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.79 
 
 		 1072 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  26.22 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5241  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.56 
 
 		 1099 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  24.53 
 
 		 355 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.42 
 
 		 1099 aa  49.7  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25 
 
 		 1099 aa  49.7  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.46 
 
 		 354 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0613  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.82 
 
 		 1073 aa  49.3  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.438109  normal  0.344128 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2118  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.04 
 
 		 1077 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2208  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.04 
 
 		 1077 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2572  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  27.81 
 
 		 1073 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0164695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1729  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.04 
 
 		 1077 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1457  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.03 
 
 		 1109 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  25.76 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2808  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.96 
 
 		 1097 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0916  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.67 
 
 		 1038 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.150361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2072  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.19 
 
 		 1083 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.471557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4285  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.88 
 
 		 1105 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02243  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.66 
 
 		 1073 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1355  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.78 
 
 		 1092 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0316249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3012  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.6 
 
 		 1107 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.541011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2272  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.71 
 
 		 1030 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  26.4 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4034  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.45 
 
 		 1071 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00188727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2340  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.37 
 
 		 1110 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0789  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.29 
 
 		 1079 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0639  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.29 
 
 		 1079 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  25.88 
 
 		 467 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0333  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.07 
 
 		 1087 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.639877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1276  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.04 
 
 		 1081 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3911  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.65 
 
 		 1066 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.123492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1774  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.04 
 
 		 1081 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000157385  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0977  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.91 
 
 		 1072 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0672  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.62 
 
 		 1107 aa  46.6  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.715776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.04 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13230  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.85 
 
 		 1093 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.94923  normal  0.975818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  24.16 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1651  carbamoyl-phosphate synthase, medium subunit  25 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0173  carbamoyl-phosphate synthase, medium subunit  24.4 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2138  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.23 
 
 		 1085 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0923584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1298  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.26 
 
 		 1093 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0243124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3358  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.73 
 
 		 1072 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2232  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.2 
 
 		 1079 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4534  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.09 
 
 		 1067 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0530  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  34.21 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0911  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.22 
 
 		 1081 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2127  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.89 
 
 		 1086 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2581  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.79 
 
 		 1109 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1088  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.26 
 
 		 1157 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0593  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.81 
 
 		 1074 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.820402  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0615  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.79 
 
 		 1064 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.120313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0124  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.01 
 
 		 938 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3122  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.26 
 
 		 1124 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1217  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.26 
 
 		 1157 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3458  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.79 
 
 		 1071 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0008  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.43 
 
 		 1080 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  22.8 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1967  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.42 
 
 		 1076 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00086  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.99 
 
 		 1080 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2079  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.17 
 
 		 1082 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0359545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>