29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1663 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  100 
 
 		 391 aa  797    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  32.44 
 
 		 443 aa  168  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  26.97 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  28.24 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  27.02 
 
 		 426 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  28.53 
 
 		 413 aa  123  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  27.27 
 
 		 753 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  23.37 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  25.15 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  23.33 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  22.84 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  24.53 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  23.38 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  22.89 
 
 		 441 aa  96.7  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  22.12 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  21.28 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  24.78 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  23.99 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  30.2 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  23.45 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  20.58 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  22.22 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  21.21 
 
 		 349 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  21.82 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03535  solid-state culture specific protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00130)  20.58 
 
 		 462 aa  46.2  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  23.04 
 
 		 467 aa  46.6  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  36.07 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  18.92 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  35.71 
 
 		 1063 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>