21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1460 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  100 
 
 
387 aa  789    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  43.68 
 
 
405 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  43.13 
 
 
405 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  38.56 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  27.5 
 
 
411 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  26.67 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  24.18 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  23.29 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  23.56 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  22.15 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  22.12 
 
 
408 aa  60.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  22.44 
 
 
443 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  22.76 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  25.54 
 
 
383 aa  56.2  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  25.42 
 
 
418 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  24.39 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  24.77 
 
 
443 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  24.92 
 
 
424 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  22.71 
 
 
695 aa  47.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  23.14 
 
 
418 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  22.99 
 
 
434 aa  43.1  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>