56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1730 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  100 
 
 		 418 aa  843    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  64.41 
 
 		 426 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  45.63 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  44.99 
 
 		 415 aa  345  6e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  45.75 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  40.82 
 
 		 413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  42.57 
 
 		 421 aa  302  9e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  43.54 
 
 		 443 aa  282  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  39.85 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  36.34 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  30.3 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  29.85 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  35.37 
 
 		 753 aa  224  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  31.86 
 
 		 413 aa  223  6e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  29.14 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  24.53 
 
 		 391 aa  107  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  24.22 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  25.37 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  27.46 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  27.33 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  23.89 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  27.05 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  26.95 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  27.46 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  21.5 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  25.1 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  27.37 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  27.11 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  27.51 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  27.62 
 
 		 349 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  31.34 
 
 		 322 aa  53.9  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  23.83 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  25.26 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  27.94 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  26.72 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  25.08 
 
 		 312 aa  50.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  25.87 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  24.88 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  26.09 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  25.13 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2197  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.6 
 
 		 1102 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1670  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.58 
 
 		 1078 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.63 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2138  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.94 
 
 		 1085 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0923584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  26.7 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.86 
 
 		 1075 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  22.97 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  23 
 
 		 387 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12690  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.23 
 
 		 1118 aa  43.9  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359466  normal  0.0639836 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20 
 
 		 1082 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  40 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0917  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.28 
 
 		 1131 aa  43.5  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0352  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.09 
 
 		 1075 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000999114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3514  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.37 
 
 		 1067 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191871  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2750  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.81 
 
 		 1120 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1900  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20 
 
 		 1082 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00662116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>