72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0164 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  100 
 
 		 416 aa  874    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  30.18 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  29.18 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  26.87 
 
 		 411 aa  136  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  27.27 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  26.74 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  27.38 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  26.4 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  26.05 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  24.43 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  26.13 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  25.08 
 
 		 695 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  23.84 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  25.91 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  23.1 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  24.82 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  23.11 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  26.01 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  23.3 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  25.53 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  23.05 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  28.63 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  23.94 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  22.82 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  23.56 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  21.6 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  25.35 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  21.82 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  22.46 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  22.58 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  30.2 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  20.74 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  21.76 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  24.2 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  21.73 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  25.57 
 
 		 753 aa  57  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  24.84 
 
 		 387 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  24.19 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  23.65 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  24.62 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  22.78 
 
 		 415 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  24.49 
 
 		 643 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  22 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  22.06 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  20.89 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  26.67 
 
 		 525 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2223  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  29.73 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  23.08 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  22.79 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  22.78 
 
 		 426 aa  47.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  20.51 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4534  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.73 
 
 		 1067 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.04 
 
 		 1074 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  22.08 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  28.34 
 
 		 375 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_11  predicted protein  24.02 
 
 		 1994 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  22.04 
 
 		 439 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  18.84 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4290  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  29.73 
 
 		 591 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.28 
 
 		 1042 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  22.63 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.01 
 
 		 1075 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  21.74 
 
 		 349 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  25.79 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3603  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.14 
 
 		 1067 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0597  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.4 
 
 		 457 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3215  pyruvate carboxylase  22.9 
 
 		 1148 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3114  pyruvate carboxylase  22.9 
 
 		 1148 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3514  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.14 
 
 		 1067 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5380  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP- binding protein  24.8 
 
 		 1829 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0382396  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06450  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  22.4 
 
 		 458 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2921  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.57 
 
 		 450 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>