41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1888 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 441 aa  894    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  48.54 
 
 		 415 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  48.64 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  47.85 
 
 		 421 aa  360  3e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  45.63 
 
 		 418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  44.85 
 
 		 413 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  42.79 
 
 		 426 aa  318  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  43.3 
 
 		 419 aa  300  4e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  36.7 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  35.98 
 
 		 753 aa  232  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  37.74 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  29.93 
 
 		 408 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  30.15 
 
 		 443 aa  206  8e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  30.49 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  28.4 
 
 		 414 aa  176  8e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  22.89 
 
 		 391 aa  96.7  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  24.8 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  25.81 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  31.22 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  30.22 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  30.22 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  26.48 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  24.63 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  28.33 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  24.2 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  27.22 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  24.71 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  28.44 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  28.38 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  26.17 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  25.75 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  25.4 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  29.32 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.46 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22 
 
 		 1082 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  26.5 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  25.73 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  29.31 
 
 		 322 aa  44.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  26.11 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  23.5 
 
 		 359 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>