64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0189 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  790    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  62.18 
 
 		 410 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  26.56 
 
 		 399 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  26.33 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  32.5 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  26.74 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  29.85 
 
 		 383 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  26.7 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  26.43 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  28.62 
 
 		 427 aa  90.1  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  26.47 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  24.72 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  30.08 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  27.82 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  27.02 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  30.16 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  29.02 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  28.02 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  27.31 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  25.14 
 
 		 695 aa  77  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  26.63 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  28.96 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  28.65 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  27.11 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  23.46 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  27.11 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  25.64 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  24.03 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  27.2 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  30.43 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  23.03 
 
 		 753 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  26.02 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  27.33 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  24.19 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  25.72 
 
 		 439 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  24.39 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  20.7 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  25.2 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  26.96 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  30.62 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  20.58 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  22.87 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  24.88 
 
 		 359 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  25.75 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  22.53 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  24.25 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  27 
 
 		 361 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  22.84 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  22.75 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.04 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  24.49 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  23.81 
 
 		 355 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  25.4 
 
 		 441 aa  47.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  25.61 
 
 		 457 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  23.71 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1375  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  24.16 
 
 		 485 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0154864  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1501  hypothetical protein  27.92 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1064  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  24.4 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000351305  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  24.62 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  23.37 
 
 		 430 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  26.67 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10083  pyruvate carboxylase  26.53 
 
 		 1150 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.667166  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  23.81 
 
 		 1145 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  23.17 
 
 		 360 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>