96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0579 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  100 
 
 
339 aa  697    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  35.1 
 
 
383 aa  176  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  35.99 
 
 
346 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  31.27 
 
 
404 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  31.46 
 
 
412 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  31.56 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  28.57 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  29.54 
 
 
695 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  37.78 
 
 
440 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  26.05 
 
 
349 aa  99.4  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  27.95 
 
 
439 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  30.92 
 
 
427 aa  96.3  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  35.81 
 
 
525 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  28.23 
 
 
418 aa  92.8  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  26.42 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  25.76 
 
 
467 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  36.21 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  26.02 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  26.98 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  28.96 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  24.68 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  23.79 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  24.5 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  21.83 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  24.21 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4422  hypothetical protein  23.31 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  25.35 
 
 
416 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.79 
 
 
326 aa  62.8  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  25.93 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  25.35 
 
 
405 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  22.83 
 
 
484 aa  60.1  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  23.98 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  24.88 
 
 
405 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  23.46 
 
 
355 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  20.98 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  25.41 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.42 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.43 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  20 
 
 
356 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  20 
 
 
356 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.23 
 
 
1067 aa  56.6  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  24.11 
 
 
346 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  20.96 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1703  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.11 
 
 
1051 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0115  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.82 
 
 
1056 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8506  hypothetical protein  29.82 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  24.6 
 
 
382 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  22.27 
 
 
322 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  22.73 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2479  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.45 
 
 
461 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1521  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.56 
 
 
494 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  18.81 
 
 
418 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  21.51 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.12 
 
 
1057 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  20.35 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  22.58 
 
 
318 aa  50.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  21.03 
 
 
337 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0632  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.4 
 
 
1120 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298922  normal  0.175677 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.35 
 
 
1065 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  24.2 
 
 
418 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  24.07 
 
 
1209 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2327  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  24.89 
 
 
450 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000401925  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0138  pyruvate carboxylase subunit A  21.26 
 
 
500 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.732252  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0946  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  24.03 
 
 
448 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735057  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5868  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.81 
 
 
462 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  22.81 
 
 
1822 aa  46.6  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.08 
 
 
1057 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.08 
 
 
1057 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1030  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  22.59 
 
 
455 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1541  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.19 
 
 
1077 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0243  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  26.98 
 
 
558 aa  46.2  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1281  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.87 
 
 
1074 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2383  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.01 
 
 
462 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1375  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  26.03 
 
 
485 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0154864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2914  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.97 
 
 
1070 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.76 
 
 
1074 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1096  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  21.76 
 
 
455 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  25.66 
 
 
1210 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.46 
 
 
1082 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3502  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.18 
 
 
452 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2576  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.14 
 
 
1067 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1225  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  21.76 
 
 
455 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.181217  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0144  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.8 
 
 
1025 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.2 
 
 
1062 aa  43.9  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6042  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  21.34 
 
 
451 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.650251  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  21.51 
 
 
457 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2897  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.14 
 
 
1067 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0244  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  24.12 
 
 
451 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.26 
 
 
269 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50410  Multifunctional pyrimidine synthesis protein CAD (includes carbamoyl-phophate synthetase, aspartate transcarbamylase, and glutamine amidotransferase)  28.42 
 
 
1148 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.280294  normal  0.615916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.22 
 
 
322 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.54 
 
 
1071 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1012  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  19.79 
 
 
1079 aa  42.7  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4216  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  24.05 
 
 
449 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1868  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.17 
 
 
1067 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.41 
 
 
413 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>