More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0421 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  640    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  36.22 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  36.31 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  34.23 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  35.03 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  35.96 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  24.28 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.16 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  26.56 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  24.58 
 
 		 334 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  26.13 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.34 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  23.31 
 
 		 361 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.96 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.06 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  24.37 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  32.96 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  28.57 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  23.4 
 
 		 484 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.48 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.76 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  26.15 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  23.68 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  23.32 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  23.73 
 
 		 375 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 		 677 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  31.87 
 
 		 428 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  27.31 
 
 		 322 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2576  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.24 
 
 		 1067 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  24.73 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  23.69 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  23.81 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2897  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.24 
 
 		 1067 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  23.32 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  19.57 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  22.41 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.16 
 
 		 1071 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.81 
 
 		 1040 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0949  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.37 
 
 		 1072 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.742849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.1 
 
 		 1079 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  20.78 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0616  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.35 
 
 		 1071 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  22.74 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1378  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25 
 
 		 1075 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  19.78 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  22.26 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.67 
 
 		 1067 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2446  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  30 
 
 		 1106 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  23.1 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  22.38 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  22.38 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  22.38 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.91 
 
 		 1072 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0632  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.1 
 
 		 1120 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298922  normal  0.175677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  21.75 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.97 
 
 		 1042 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2352  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.27 
 
 		 1074 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  24.4 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  23.98 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.03 
 
 		 1082 aa  59.7  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1782  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.91 
 
 		 1054 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0541  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.73 
 
 		 1066 aa  59.3  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1670  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.17 
 
 		 1078 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2456  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.56 
 
 		 1096 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  21.94 
 
 		 891 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1868  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  27.08 
 
 		 1067 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.03 
 
 		 1057 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0939  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.11 
 
 		 1068 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.245842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4016  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.36 
 
 		 1065 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  19.72 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0583  MGS domain protein  24 
 
 		 530 aa  57  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.774187  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.6 
 
 		 1496 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1251  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.1 
 
 		 1067 aa  56.6  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  23.35 
 
 		 900 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  23.35 
 
 		 914 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0586  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.74 
 
 		 1076 aa  56.2  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  20.51 
 
 		 1064 aa  56.2  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2001  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.28 
 
 		 946 aa  56.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.890669  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0243  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  26.92 
 
 		 558 aa  56.2  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  23.35 
 
 		 900 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1900  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.42 
 
 		 1082 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00662116  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0613  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.39 
 
 		 1073 aa  55.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.438109  normal  0.344128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  24.6 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  28.05 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.42 
 
 		 1082 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1879  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.51 
 
 		 1110 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.85 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0615  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.16 
 
 		 1064 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.120313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  21.94 
 
 		 924 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  26.62 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2914  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.49 
 
 		 1070 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.36 
 
 		 1060 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  23.86 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.03 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0679  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.66 
 
 		 1095 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12823  carbamoyl-phosphate synthase, large (or ammonia) subunit (carB)  24.81 
 
 		 950 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.188852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  21.94 
 
 		 894 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  21.72 
 
 		 896 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.47 
 
 		 1082 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00913  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.96 
 
 		 1077 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>