56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4658 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  699    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  35.63 
 
 		 335 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  31.01 
 
 		 371 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  27.76 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  28.21 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  27.56 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  28.05 
 
 		 375 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  27.72 
 
 		 372 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  27.51 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  27.86 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  26.85 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  25.16 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  24.9 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  35.48 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  34.19 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  34.19 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  25.26 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  24.21 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.08 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  25.58 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.37 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  22.93 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  24.84 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.59 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  30 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  19.72 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  20.21 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2576  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.14 
 
 		 1067 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2897  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.14 
 
 		 1067 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  25.82 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.42 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  24.21 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  23.94 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.91 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  27.42 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.42 
 
 		 1062 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1042 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.89 
 
 		 1065 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1775  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.69 
 
 		 1073 aa  46.6  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0103005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  29.31 
 
 		 428 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.15 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  31.3 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.7 
 
 		 1065 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1852  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.92 
 
 		 1072 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  22.1 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3713  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21 
 
 		 1072 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.91 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.15 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0060  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.88 
 
 		 1065 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3931  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.67 
 
 		 1072 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2272  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.32 
 
 		 1030 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.17 
 
 		 1040 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  26.04 
 
 		 809 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.27 
 
 		 1057 aa  42.7  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.68 
 
 		 324 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22 
 
 		 1067 aa  42.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>