223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0588 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  100 
 
 		 320 aa  638    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  48.6 
 
 		 326 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  44.72 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  40.92 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  40.71 
 
 		 343 aa  219  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  36.57 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  36.31 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  35.05 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  31.41 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  33.54 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  30.52 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  32.54 
 
 		 333 aa  135  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  31.38 
 
 		 363 aa  133  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  28.67 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  30.53 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  28.66 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  29.45 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  29.14 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.12 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.7 
 
 		 677 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  27.39 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  26.1 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.61 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  29.39 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.44 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  27.94 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  28.08 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  25.08 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.1 
 
 		 1057 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.51 
 
 		 1057 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.51 
 
 		 1057 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  25.38 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  25.37 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30.7 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  25.17 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0541  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.58 
 
 		 1066 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  26.53 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0616  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.28 
 
 		 1071 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 430 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  25.42 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  25.7 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  24.01 
 
 		 439 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.72 
 
 		 1072 aa  57  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  27.73 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  25.24 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  24.39 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  30.77 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  24.41 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  23.97 
 
 		 387 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2001  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.79 
 
 		 946 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.890669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2914  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.47 
 
 		 1070 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  25.54 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  22.68 
 
 		 416 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.24 
 
 		 1040 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  28.19 
 
 		 383 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  32.39 
 
 		 330 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  26.94 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.33 
 
 		 1067 aa  52.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2576  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.75 
 
 		 1067 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0949  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.88 
 
 		 1072 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.742849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  30.18 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.18 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2446  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.95 
 
 		 1106 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  24.35 
 
 		 891 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  30.18 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  30.18 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  30.18 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  30.18 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.15 
 
 		 1064 aa  50.8  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.87 
 
 		 415 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  31.69 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  23.55 
 
 		 734 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  33.02 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2197  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.89 
 
 		 1102 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  29.59 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2897  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.5 
 
 		 1067 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2669  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.28 
 
 		 1069 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  24.73 
 
 		 427 aa  50.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12823  carbamoyl-phosphate synthase, large (or ammonia) subunit (carB)  27.07 
 
 		 950 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.188852  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.44 
 
 		 1064 aa  50.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.71 
 
 		 1079 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  22.65 
 
 		 410 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  31.65 
 
 		 382 aa  49.7  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0099  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.6 
 
 		 951 aa  49.7  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.217171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  25.22 
 
 		 367 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  25.69 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1347  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.05 
 
 		 417 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.207795  normal  0.112273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.56 
 
 		 425 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  25.82 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  30.99 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81158  acetyl-coenzyme-A carboxylase  28.99 
 
 		 2224 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.783677 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3707  pyruvate carboxylase  26.11 
 
 		 1148 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.863258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 896 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  24 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 894 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 924 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 904 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 926 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  21.86 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>