65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1919 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  577  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  40.34 
 
 		 291 aa  175  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0342  protein of unknown function DUF201  41.24 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  29.82 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  28.1 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  24.73 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  26.01 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  27.57 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.27 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  28.1 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  28.57 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  25 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  23.56 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.19 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.24 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  24.2 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  22.22 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  23.21 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  23.02 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  22.97 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.54 
 
 		 320 aa  53.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.7 
 
 		 354 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.42 
 
 		 282 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 677 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.96 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.04 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  25.89 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0029  protein of unknown function DUF201  30.15 
 
 		 386 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  23.28 
 
 		 695 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  21.56 
 
 		 336 aa  46.6  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.93 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  23.61 
 
 		 430 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.17 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  21.84 
 
 		 387 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  21.9 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  36.47 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.03 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  21.9 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.11 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  21.74 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0880  GDP-mannose 4,6-dehydratase  35.29 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  29.83 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0400  GDP-mannose 4,6-dehydratase  35.29 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  21.13 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  20.13 
 
 		 458 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  29.83 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.67 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  35.8 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  31 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  35.8 
 
 		 346 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  24.38 
 
 		 424 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  35.71 
 
 		 355 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1784  D-alanine--D-alanine ligase  23.44 
 
 		 325 aa  42.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  22.73 
 
 		 439 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.19 
 
 		 418 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.5 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  24.32 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  28.57 
 
 		 914 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  18.5 
 
 		 334 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  21.17 
 
 		 387 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  35.71 
 
 		 343 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  23.08 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.4 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  35.29 
 
 		 344 aa  42  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.65 
 
 		 328 aa  42.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>