34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3856 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  952    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  65.62 
 
 
454 aa  620  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  62.11 
 
 
452 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  52.23 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06402  conserved hypothetical protein  28.34 
 
 
816 aa  186  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0546217 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  28.77 
 
 
360 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  29.12 
 
 
387 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  29.2 
 
 
387 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  28.57 
 
 
387 aa  160  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  28.85 
 
 
387 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  31.45 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  24.57 
 
 
397 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002731  carbamoylphosphate synthase large subunit  24.32 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07622  conserved hypothetical protein  23.26 
 
 
494 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  22.15 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  22.79 
 
 
513 aa  60.1  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  22.47 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  20.07 
 
 
439 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  21.58 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  20.98 
 
 
387 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  25.64 
 
 
356 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  23.59 
 
 
418 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  24.26 
 
 
355 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  21.9 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  25.65 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  25.65 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  20.51 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  23.92 
 
 
408 aa  45.8  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  21.36 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  20.54 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  21.13 
 
 
383 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  25.27 
 
 
484 aa  44.3  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  20.13 
 
 
284 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  23.13 
 
 
525 aa  43.5  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>