22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002731 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002731  carbamoylphosphate synthase large subunit  100 
 
 		 370 aa  776    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  28.98 
 
 		 387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  28.98 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  28.46 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  27.2 
 
 		 387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  31.94 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  30.55 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  24.91 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  28.62 
 
 		 452 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  25.09 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  24.32 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  24.14 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  21.53 
 
 		 513 aa  57  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  23.36 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  27.1 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  24.29 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  24 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06402  conserved hypothetical protein  23.3 
 
 		 816 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0546217 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  25 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  23.32 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  22.58 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  28.49 
 
 		 325 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>