43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2876 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  100 
 
 		 734 aa  1521    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  25.39 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.86 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  27.27 
 
 		 390 aa  60.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  25.86 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.89 
 
 		 354 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.38 
 
 		 1075 aa  55.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  24.82 
 
 		 386 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.21 
 
 		 326 aa  53.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  27.24 
 
 		 404 aa  52  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1651  carbamoyl-phosphate synthase, medium subunit  23.29 
 
 		 492 aa  51.2  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.55 
 
 		 320 aa  50.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  23.08 
 
 		 312 aa  50.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  21.84 
 
 		 342 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.81 
 
 		 1074 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0173  carbamoyl-phosphate synthase, medium subunit  22.67 
 
 		 492 aa  49.3  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  22.78 
 
 		 410 aa  48.5  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  23.94 
 
 		 349 aa  48.5  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  36.76 
 
 		 440 aa  48.5  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  23.48 
 
 		 327 aa  48.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12580  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.84 
 
 		 1101 aa  46.6  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0991038  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0467  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  22.74 
 
 		 495 aa  47  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.6 
 
 		 1099 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1477  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.81 
 
 		 1054 aa  47  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2313  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  30.58 
 
 		 1079 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.417995  normal  0.014378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  24.88 
 
 		 411 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  28.03 
 
 		 1064 aa  46.2  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0534  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  22.98 
 
 		 495 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.701669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1120  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  22.94 
 
 		 554 aa  46.6  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1692  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.93 
 
 		 1089 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0489  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  22.53 
 
 		 495 aa  45.8  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.3 
 
 		 1099 aa  45.8  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1849  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.59 
 
 		 1115 aa  45.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  18.85 
 
 		 322 aa  45.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  22.8 
 
 		 383 aa  45.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1856  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.26 
 
 		 1115 aa  45.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.977925 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  22.59 
 
 		 695 aa  45.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1395  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.71 
 
 		 1087 aa  44.7  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.943513  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  35.9 
 
 		 525 aa  44.3  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  24.74 
 
 		 412 aa  44.3  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5241  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.91 
 
 		 1099 aa  44.3  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0649  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  22.98 
 
 		 492 aa  44.3  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2639  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.73 
 
 		 1105 aa  43.9  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>