168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3255 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 327 aa  664    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  44.72 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  42.28 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  39.04 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  34.62 
 
 		 312 aa  198  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  34.49 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  33.43 
 
 		 343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  31.85 
 
 		 354 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  35.96 
 
 		 321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  28.35 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  29.83 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  27.91 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  28.89 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  27.11 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  28.62 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  30.42 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  27.03 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  29.09 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  28.21 
 
 		 375 aa  99.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  25.15 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  25.82 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  30.66 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.21 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 677 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  25.09 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  26.69 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.65 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  24.71 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  24.83 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  24.23 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  23.74 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  25.8 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  24.51 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  22.93 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  29.67 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  29.03 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  29.23 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  26.6 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  31.55 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  25.23 
 
 		 914 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  25.23 
 
 		 900 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  22.22 
 
 		 894 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  22.8 
 
 		 924 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  22.03 
 
 		 896 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  22.56 
 
 		 926 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  29.73 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  24.56 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3022  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.61 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.289298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  24.77 
 
 		 900 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  29.73 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_002978  WD0095  D-alanine--D-alanine ligase  25.49 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.798262  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  29.73 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  29.73 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  21.76 
 
 		 891 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  22.11 
 
 		 904 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  28.37 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  22.11 
 
 		 904 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  27.41 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  21.89 
 
 		 912 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  29.73 
 
 		 313 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  26.95 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  27.66 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  27.66 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  26.95 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  23.78 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  22.94 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0137  D-alanine/D-alanine ligase  25.16 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000588497  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  26.25 
 
 		 404 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  26.95 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  26.95 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  24.05 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  28.32 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  25.93 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5793  D-alanine--D-lactate ligase  23.75 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  27.41 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.81 
 
 		 410 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  21.9 
 
 		 467 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  23.38 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  23.38 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  26.03 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  29.2 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1643  D-alanine--D-alanine ligase  26.73 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  23.81 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  20.78 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  26.15 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  23.3 
 
 		 349 aa  49.7  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  27.87 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  23.28 
 
 		 399 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  26.56 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.79 
 
 		 410 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  26.56 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  25.66 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  32.14 
 
 		 525 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  25.29 
 
 		 412 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1092  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  26.85 
 
 		 392 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  27.04 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  23.48 
 
 		 734 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  25.3 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  23.78 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  25.87 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>