28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5257 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  100 
 
 
363 aa  732    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  31.38 
 
 
320 aa  133  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  32.94 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.46 
 
 
322 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.77 
 
 
326 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  25.15 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  26.93 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.18 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  30.74 
 
 
484 aa  77  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  28.53 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  27.34 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  29.24 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.52 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  19.57 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  29.91 
 
 
333 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  24.12 
 
 
322 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  25.75 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  25.38 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  28.26 
 
 
322 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  26.82 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.52 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  32.72 
 
 
346 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  44 
 
 
439 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  19.53 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  20.23 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  29.63 
 
 
317 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  20.23 
 
 
349 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>