15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4422 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4422  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  701    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  26.07 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  23.31 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  28.33 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  23.6 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  26.09 
 
 		 404 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  25.6 
 
 		 440 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  28.33 
 
 		 404 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  28.18 
 
 		 439 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  21.7 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  26.13 
 
 		 427 aa  50.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  27.72 
 
 		 695 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  22.22 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  25 
 
 		 525 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  26.61 
 
 		 418 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>