25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0762 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  90.18 
 
 
391 aa  748    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  814    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  65.31 
 
 
372 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  35.73 
 
 
352 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  32.44 
 
 
354 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  34.95 
 
 
332 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  34.14 
 
 
332 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  30.94 
 
 
353 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  30.94 
 
 
353 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  30.66 
 
 
352 aa  172  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  27.6 
 
 
335 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  27.86 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  23.84 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  26.4 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  26.34 
 
 
337 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  25.65 
 
 
395 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.51 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  27.43 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  22.32 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  22.32 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  21.24 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  24.56 
 
 
484 aa  46.2  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  26.32 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.95 
 
 
1062 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  22.54 
 
 
356 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.401732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>