39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4985 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  789    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  35.49 
 
 		 371 aa  193  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  30.18 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  29.14 
 
 		 339 aa  130  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  30.65 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  28.36 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  26.86 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  27.69 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  25.83 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  28.05 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  30.88 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  26.85 
 
 		 353 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  27.18 
 
 		 352 aa  67  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  26.26 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  29.43 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  25.37 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  23.35 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  25.34 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  29.05 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  28.32 
 
 		 809 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  24.1 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  19.06 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.48 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  27.62 
 
 		 325 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  22.33 
 
 		 312 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  24.73 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.88 
 
 		 1042 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  27.39 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0976  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.35 
 
 		 1073 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3153  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.77 
 
 		 1105 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184389 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  30.43 
 
 		 802 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.66 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2838  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.34 
 
 		 1073 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  27.1 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2352  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.76 
 
 		 1074 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  25 
 
 		 430 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  27.19 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4090  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  31.97 
 
 		 660 aa  43.1  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.734303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  28 
 
 		 429 aa  42.7  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>