22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0661 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  99.43 
 
 
353 aa  727    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  734    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  99.15 
 
 
353 aa  725    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  55.59 
 
 
354 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  54.57 
 
 
352 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  40.84 
 
 
332 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  40.51 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  32.51 
 
 
372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  30.21 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  30.66 
 
 
388 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  31.91 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  29.39 
 
 
371 aa  99.8  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  35.48 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  27.18 
 
 
375 aa  63.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  26.37 
 
 
395 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  34.78 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  35.51 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  31.62 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  25 
 
 
351 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  20.8 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  23.05 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  26.15 
 
 
429 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>