23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  741    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  36.05 
 
 		 395 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  31.01 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  33.84 
 
 		 335 aa  149  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  29.07 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  29.07 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  29.39 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  29.55 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  28.53 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  29.05 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  29.69 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  29.69 
 
 		 332 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  24.24 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  23.84 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  25.26 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  23.84 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  29.86 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.64 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  21.02 
 
 		 326 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  26.42 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.22 
 
 		 1065 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  25.48 
 
 		 430 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.42 
 
 		 1082 aa  43.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>