30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3693 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 354 aa  732    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  60.23 
 
 		 352 aa  434  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  56.16 
 
 		 353 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  56.16 
 
 		 353 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  55.59 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  44.08 
 
 		 332 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  44.08 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  36.14 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  32.98 
 
 		 391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  32.44 
 
 		 388 aa  192  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  30.31 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  28.53 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  25.16 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  33.02 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  27.33 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  32.08 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  26.24 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  35.51 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  23.39 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  33.96 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1782  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  30.95 
 
 		 1054 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  26.2 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  26.2 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.69 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  22.5 
 
 		 355 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  22.77 
 
 		 409 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.94 
 
 		 330 aa  46.2  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  25.7 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1386  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  30.63 
 
 		 752 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  32.69 
 
 		 429 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>